Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G123800.1
Synonym Sb09g019160
Functional annotation josephin, putative, expressed
UniProt A0A1B6P8E3
Pfam PF02099
Panther DB PTHR14159
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11863; ATXN3, Ataxin-3
Gene Ontology GO:0008242; omega peptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54130 : Josephin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g63250.1 : josephin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G291800 - -
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15 Sobic.003G020100 - -
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19 Sobic.005G036700 expressed protein -
20 Sobic.003G261300 arginine/serine-rich coiled-coil protein 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G123800 Sobic009G123800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G123800--Sobic004G291800 Sobic002G171700 Sobic002G171700 Sobic009G123800--Sobic002G171700 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G123800--Sobic009G110366 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic009G123800--Sobic005G077400 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic009G123800--Sobic005G099150 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic009G123800--Sobic007G130100 Sobic005G028400 Sobic005G028400 Sobic009G123800--Sobic005G028400 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic009G123800--Sobic008G079100 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G123800--Sobic004G020401 Sobic004G291800--Sobic004G020401 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G110366 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic004G291800--Sobic002G212800 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic007G112900 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic004G291800--Sobic009G109450 Sobic004G291800--Sobic007G130100 Sobic006G273100 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Sobic004G020401--Sobic001G479500 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic004G020401--Sobic003G357500 Sobic004G020401--Sobic008G161401
Octagon: transcription factors


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