Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G171700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A109NDM6 , A0A1B6QC08
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G107500 - -
2 Sobic.009G123800 josephin, putative, expressed K11863: ATXN3, Ataxin-3
3 Sobic.004G291800 - -
4 Sobic.007G115000 - -
5 Sobic.009G110366 - -
6 Sobic.008G068400 - -
7 Sobic.003G038000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Lipase class 3 family protein (At)(PubMedID : 27208977)@phospholipase, putative, expressed -
8 Sobic.006G273100 - -
9 Sobic.003G153800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Protein beta-fructofuranosidase (Os)(PubMedID : 27208977)@neutral/alkaline invertase, putative, expressed -
10 Sobic.005G055150 - -
11 Sobic.005G028400 "Ca ATPase, IIB type"(PubMedID : 22196357)@Autoihibited Ca2+ - ATPase 11(PubMedID : 26320239)@calcium-transporting ATPase, plasma membrane-type, putative, expressed K01537: P-type Ca2+ transporter type 2C
12 Sobic.009G197200 - -
13 Sobic.005G077400 - -
14 Sobic.005G117801 - -
15 Sobic.006G063300 - -
16 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
17 Sobic.008G079100 - -
18 Sobic.002G285200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR53 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
19 Sobic.007G071000 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G171700 Sobic002G171700 Sobic009G107500 Sobic009G107500 Sobic002G171700--Sobic009G107500 Sobic009G123800 Sobic009G123800 Sobic002G171700--Sobic009G123800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic002G171700--Sobic004G291800 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic002G171700--Sobic007G115000 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic002G171700--Sobic009G110366 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic002G171700--Sobic008G068400 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G171700--Sobic003G038000 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic002G171700--Sobic006G273100 Sobic003G153800 Sobic003G153800 Sobic002G171700--Sobic003G153800 Sobic010G242300 Sobic010G242300 Sobic009G107500--Sobic010G242300 Sobic002G425300 Sobic002G425300 Sobic009G107500--Sobic002G425300 Sobic009G107500--Sobic009G110366 Sobic009G107500--Sobic004G291800 Sobic005G096300 Sobic005G096300 Sobic009G107500--Sobic005G096300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic009G107500--Sobic009G197200 Sobic009G107500--Sobic002G171700 Sobic002G226000 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Sobic006G152500 Sobic006G152500 Sobic003G153800--Sobic006G152500
Octagon: transcription factors


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