Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G107500.2
Synonym Sb09g017290
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R209
Pfam PF06521
Panther DB PTHR33649 PTHR33649:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54040 : PAR1 protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043402
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G242300 TKL_IRAK_DUF26-lh.6 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
2 Sobic.002G425300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16282: E3 ubiquitin-protein ligase RHA2
3 Sobic.009G110366 - -
4 Sobic.004G291800 - -
5 Sobic.005G096300 Up-regulated in Setosphaeria turcica resistant genotype GA06/18 by S. turcica inoculation(PubMedID : 22050783)@-(PubMedID : 25928459)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
6 Sobic.009G197200 - -
7 Sobic.002G171700 - -
8 Sobic.002G226000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G198900 trehalose synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
10 Sobic.010G280100 expressed protein -
11 Sobic.002G020800 expressed protein -
12 Sobic.004G020401 - -
13 Sobic.007G035600 MSP domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G054100 stress-induced protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G195700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G137800 expressed protein -
17 Sobic.008G079100 - -
18 Sobic.008G068400 - -
19 Sobic.005G121800 expressed protein -
20 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G107500 Sobic009G107500 Sobic010G242300 Sobic010G242300 Sobic009G107500--Sobic010G242300 Sobic002G425300 Sobic002G425300 Sobic009G107500--Sobic002G425300 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G107500--Sobic009G110366 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G107500--Sobic004G291800 Sobic005G096300 Sobic005G096300 Sobic009G107500--Sobic005G096300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic009G107500--Sobic009G197200 Sobic002G171700 Sobic002G171700 Sobic009G107500--Sobic002G171700 Sobic002G226000 Sobic002G226000 Sobic009G107500--Sobic002G226000 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic009G107500--Sobic009G198900 Sobic010G242300--Sobic009G107500 Sobic007G035600 Sobic007G035600 Sobic010G242300--Sobic007G035600 Sobic010G242300--Sobic005G096300 Sobic010G242300--Sobic009G198900 Sobic004G195700 Sobic004G195700 Sobic010G242300--Sobic004G195700 Sobic005G012000 Sobic005G012000 Sobic010G242300--Sobic005G012000 Sobic005G222700 Sobic005G222700 Sobic010G242300--Sobic005G222700 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic010G242300--Sobic004G020401 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic010G242300--Sobic007G073400 Sobic003G074500 Sobic003G074500 Sobic002G425300--Sobic003G074500 Sobic010G273600 Sobic010G273600 Sobic002G425300--Sobic010G273600 Sobic002G425300--Sobic009G107500 Sobic007G071000 Sobic007G071000 Sobic002G425300--Sobic007G071000 Sobic003G264901 Sobic003G264901 Sobic002G425300--Sobic003G264901 Sobic001G511000 Sobic001G511000 Sobic002G425300--Sobic001G511000 Sobic002G425300--Sobic004G291800 Sobic009G082200 Sobic009G082200 Sobic002G425300--Sobic009G082200 Sobic001G053900 Sobic001G053900 Sobic002G425300--Sobic001G053900 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic004G291800--Sobic004G020401 Sobic004G291800--Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G110366 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic004G291800--Sobic002G212800 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic009G109450 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic007G130100 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic004G291800--Sobic006G273100 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic004G291800--Sobic003G057800 Sobic005G096300--Sobic007G035600 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic005G096300--Sobic010G280100 Sobic010G111800 Sobic010G111800 Sobic005G096300--Sobic010G111800 Sobic003G154700 Sobic003G154700 Sobic005G096300--Sobic003G154700 Sobic009G232700 Sobic009G232700 Sobic005G096300--Sobic009G232700 Sobic005G096300--Sobic010G242300 Sobic004G119000 Sobic004G119000 Sobic005G096300--Sobic004G119000 Sobic004G150400 Sobic004G150400 Sobic005G096300--Sobic004G150400 Sobic001G368400 Sobic001G368400 Sobic005G096300--Sobic001G368400 Sobic009G197200--Sobic004G291800 Sobic009G197200--Sobic004G020401 Sobic009G197200--Sobic009G110366 Sobic009G197200--Sobic009G109450 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic006G273100 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic009G197200--Sobic008G091671 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic002G212800 Sobic002G171700--Sobic009G107500 Sobic009G123800 Sobic009G123800 Sobic002G171700--Sobic009G123800 Sobic002G171700--Sobic004G291800 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic002G171700--Sobic007G115000 Sobic002G171700--Sobic009G110366 Sobic002G171700--Sobic008G068400 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G171700--Sobic003G038000 Sobic002G171700--Sobic006G273100 Sobic003G153800 Sobic003G153800 Sobic002G171700--Sobic003G153800 Sobic002G226000--Sobic009G198900 Sobic003G324000 Sobic003G324000 Sobic002G226000--Sobic003G324000 Sobic007G148200 Sobic007G148200 Sobic002G226000--Sobic007G148200 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic002G226000--Sobic001G543800 Sobic001G194900 Sobic001G194900 Sobic002G226000--Sobic001G194900 Sobic004G153400 Sobic004G153400 Sobic002G226000--Sobic004G153400 Sobic002G226000--Sobic010G280100 Sobic006G152600 Sobic006G152600 Sobic002G226000--Sobic006G152600 Sobic002G226000--Sobic009G180200 Sobic009G198900--Sobic003G324000 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic009G198900--Sobic009G087800 Sobic009G198900--Sobic010G280100 Sobic009G198900--Sobic003G258400 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic009G198900--Sobic005G187200 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic009G198900--Sobic007G054000 Sobic009G198900--Sobic009G110366 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic009G198900--Sobic007G205800 Sobic009G198900--Sobic006G196000
Octagon: transcription factors


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