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Transcriptome id Sobic.009G135550.1
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UniProt A0A1Z5R2K2
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G040501 - -
2 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
3 Sobic.003G233266 - -
4 Sobic.001G502801 - -
5 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
6 Sobic.001G487900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding protein, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
7 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
8 Sobic.004G032200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K02201: pantetheine-phosphate adenylyltransferase
9 Sobic.002G138400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
10 Sobic.009G143750 - -
11 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
12 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
13 Sobic.003G064901 - -
14 Sobic.006G124800 - -
15 Sobic.002G380550 - -
16 Sobic.007G149200 "DEP1/GGC2(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659905)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
17 Sobic.001G270800 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
18 Sobic.004G091900 - -
19 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
20 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein


Gene co-expression network
sample Sobic009G135550 Sobic009G135550 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic009G135550--Sobic008G040501 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic009G135550--Sobic003G169000 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic009G135550--Sobic003G233266 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic009G135550--Sobic001G502801 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic009G135550--Sobic003G169100 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic009G135550--Sobic001G487900 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic009G135550--Sobic007G145801 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic009G135550--Sobic004G032200 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic009G135550--Sobic002G138400 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic008G040501--Sobic010G214150 Sobic008G040501--Sobic003G233266 Sobic008G040501--Sobic001G502801 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic008G040501--Sobic001G300301 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic008G040501--Sobic002G380550 Sobic008G040501--Sobic004G032200 Sobic008G040501--Sobic009G135550 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic008G040501--Sobic002G358450 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic008G040501--Sobic001G270800 Sobic003G169000--Sobic003G169100 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic003G169000--Sobic007G065000 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G169000--Sobic007G149200 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G169000--Sobic003G352000 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic003G169000--Sobic003G369533 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G169000--Sobic003G168200 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G169000--SobicK029400 Sobic003G169000--Sobic007G145801 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G169000--Sobic003G218950 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic003G233266--Sobic001G331650 Sobic003G233266--Sobic008G040501 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic003G233266--Sobic004G207800 Sobic003G233266--Sobic003G169000 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic003G233266--Sobic009G101500 Sobic003G233266--Sobic001G300301 Sobic001G048500 Sobic001G048500 Sobic003G233266--Sobic001G048500 Sobic003G233266--Sobic001G502801 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic003G233266--Sobic004G077700 Sobic001G502801--Sobic001G300301 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic001G502801--Sobic009G143750 Sobic001G502801--Sobic008G040501 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G502801--Sobic005G045250 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic001G502801--Sobic006G016950 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G502801--Sobic007G183200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic010G214150 Sobic001G502801--Sobic002G358450 Sobic003G169100--Sobic003G169000 Sobic003G169100--Sobic007G065000 Sobic003G169100--Sobic007G145801 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic003G169100--Sobic009G123100 Sobic003G169100--Sobic003G168200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G169100--SobicK032300 Sobic003G169100--Sobic007G149200 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic003G169100--Sobic003G172500 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic003G169100--Sobic010G139200 Sobic001G487900--Sobic009G143750 Sobic001G075500 Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic001G075500 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic001G487900--Sobic006G124800 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic001G487900--Sobic004G210400 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic001G487900--Sobic003G172600 Sobic001G487900--Sobic003G169100 Sobic001G487900--SobicK032300 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic001G487900--Sobic007G207100 Sobic001G487900--Sobic010G139200 Sobic007G145801--Sobic009G123100 Sobic007G145801--Sobic003G169100 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic007G145801--Sobic005G139750 Sobic007G145801--Sobic006G124800 Sobic007G145801--SobicK032300 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic007G145801--Sobic010G206600 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic007G145801--Sobic006G183100 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic007G145801--Sobic009G148950 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic007G145801--Sobic006G124700 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G032200--Sobic009G102250 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G032200--Sobic003G064901 Sobic004G032200--Sobic001G270800 Sobic004G032200--Sobic008G040501 Sobic004G032200--Sobic002G138400 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic004G032200--Sobic004G091900 Sobic004G032200--Sobic001G502801 Sobic004G032200--Sobic006G016950 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic004G032200--Sobic001G167000 Sobic002G138400--Sobic003G064901 Sobic002G138400--Sobic009G102250 Sobic002G138400--Sobic001G487900 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic002G138400--Sobic001G182700 Sobic002G138400--Sobic001G075500 Sobic002G138400--Sobic006G016950 Sobic002G138400--Sobic009G143750 Sobic004G111200 Sobic004G111200 Sobic002G138400--Sobic004G111200 Sobic002G138400--Sobic003G169100
Octagon: transcription factors


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