Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G153500.1
Synonym Sb09g021700
Functional annotation ankyrin repeat family protein, putative, expressed
UniProt C5YYP6
Pfam PF13962 PF12796
Panther DB PTHR24177 PTHR24177:SF31
NCBI CDD KOG0508; Ankyrin repeat protein KOG441226S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G03500 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g35310.1 : ankyrin repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G153500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G155700 - -
2 Sobic.004G021400 endoglucanase, putative, expressed -
3 Sobic.007G087400 amino acid transporter, putative, expressed -
4 Sobic.004G232600 expressed protein -
5 Sobic.003G205600 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.004G160500 expressed protein -
7 Sobic.002G096900 autophagy-related protein 3, putative, expressed -
8 Sobic.001G348800 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
9 Sobic.010G230300 galactosyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.001G055400 WRKY6, expressed -
11 Sobic.010G195901 - -
12 Sobic.003G185300 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed K10418: dynein light chain LC8-type
13 Sobic.005G115300 expressed protein -
14 Sobic.004G312200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@WRKY32, expressed -
15 Sobic.003G215350 - -
16 Sobic.006G196400 U-box, putative, expressed -
17 Sobic.002G003400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
18 Sobic.004G248500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.007G090472 - -
20 Sobic.001G261448 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G153500 Sobic009G153500 Sobic002G155700 Sobic002G155700 Sobic009G153500--Sobic002G155700 Sobic004G021400 Sobic004G021400 Sobic009G153500--Sobic004G021400 Sobic007G087400 Sobic007G087400 Sobic009G153500--Sobic007G087400 Sobic004G232600 Sobic004G232600 Sobic009G153500--Sobic004G232600 Sobic003G205600 Sobic003G205600 Sobic009G153500--Sobic003G205600 Sobic004G160500 Sobic004G160500 Sobic009G153500--Sobic004G160500 Sobic002G096900 Sobic002G096900 Sobic009G153500--Sobic002G096900 Sobic001G348800 Sobic001G348800 Sobic009G153500--Sobic001G348800 Sobic010G230300 Sobic010G230300 Sobic009G153500--Sobic010G230300 Sobic002G155700--Sobic002G096900 Sobic002G155700--Sobic009G153500 Sobic002G155700--Sobic007G087400 Sobic002G155700--Sobic010G230300 Sobic002G155700--Sobic004G021400 Sobic002G155700--Sobic004G160500 Sobic007G083000 Sobic007G083000 Sobic002G155700--Sobic007G083000 Sobic002G155700--Sobic004G232600 Sobic008G122500 Sobic008G122500 Sobic002G155700--Sobic008G122500 Sobic004G021400--Sobic007G087400 Sobic001G542100 Sobic001G542100 Sobic004G021400--Sobic001G542100 Sobic004G021400--Sobic009G153500 Sobic007G120200 Sobic007G120200 Sobic004G021400--Sobic007G120200 Sobic004G021400--Sobic002G155700 Sobic010G062400 Sobic010G062400 Sobic004G021400--Sobic010G062400 Sobic002G222600 Sobic002G222600 Sobic004G021400--Sobic002G222600 Sobic008G164300 Sobic008G164300 Sobic004G021400--Sobic008G164300 Sobic004G079700 Sobic004G079700 Sobic004G021400--Sobic004G079700 Sobic007G087400--Sobic004G021400 Sobic007G087400--Sobic009G153500 Sobic007G087400--Sobic004G160500 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic007G087400--Sobic007G154100 Sobic007G087400--Sobic010G062400 Sobic007G087400--Sobic002G096900 Sobic007G087400--Sobic002G155700 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic007G087400--Sobic003G079100 Sobic007G087400--Sobic002G222600 Sobic004G232600--Sobic009G153500 Sobic003G256900 Sobic003G256900 Sobic004G232600--Sobic003G256900 Sobic005G170100 Sobic005G170100 Sobic004G232600--Sobic005G170100 Sobic010G027300 Sobic010G027300 Sobic004G232600--Sobic010G027300 Sobic003G086500 Sobic003G086500 Sobic004G232600--Sobic003G086500 Sobic004G232600--Sobic003G205600 Sobic008G062900 Sobic008G062900 Sobic004G232600--Sobic008G062900 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic004G232600--Sobic003G083600 Sobic004G232600--Sobic001G348800 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic003G205600--Sobic003G000100 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic003G205600--Sobic003G240400 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic003G205600--Sobic004G322100 Sobic003G205600--Sobic010G027300 Sobic008G016000 Sobic008G016000 Sobic003G205600--Sobic008G016000 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic003G205600--Sobic001G229000 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic003G205600--Sobic006G028500 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic003G205600--Sobic004G110700 Sobic004G271800 Sobic004G271800 Sobic003G205600--Sobic004G271800 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic004G160500--Sobic006G117500 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic004G160500--Sobic004G108800 Sobic007G038500 Sobic007G038500 Sobic004G160500--Sobic007G038500 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic004G160500--Sobic005G149600 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic004G160500--Sobic005G089200 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic004G160500--Sobic009G015166 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic004G160500--Sobic005G104200 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic004G160500--Sobic010G274400 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic004G160500--Sobic004G156250 Sobic002G096900--Sobic002G155700 Sobic002G096900--Sobic007G087400 Sobic002G096900--Sobic010G062400 Sobic008G014700 Sobic008G014700 Sobic002G096900--Sobic008G014700 Sobic002G096900--Sobic007G154100 Sobic002G096900--Sobic009G153500 Sobic002G096900--Sobic010G230300 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic002G096900--Sobic005G066366 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic002G096900--Sobic005G110511 Sobic001G348800--Sobic005G104200 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic001G348800--Sobic005G115300 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic001G348800--Sobic001G238500 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic001G348800--Sobic004G126500 Sobic002G238700 Sobic002G238700 Sobic001G348800--Sobic002G238700 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic001G348800--Sobic001G503000 Sobic004G248500 Sobic004G248500 Sobic001G348800--Sobic004G248500 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G348800--Sobic002G019100 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic001G348800--Sobic006G009700 Sobic010G230300--Sobic007G083000 Sobic010G230300--Sobic008G122500 Sobic003G430100 Sobic003G430100 Sobic010G230300--Sobic003G430100 Sobic004G210000 Sobic004G210000 Sobic010G230300--Sobic004G210000 Sobic005G226000 Sobic005G226000 Sobic010G230300--Sobic005G226000 Sobic010G230300--Sobic002G155700 Sobic001G458400 Sobic001G458400 Sobic010G230300--Sobic001G458400 Sobic007G208200 Sobic007G208200 Sobic010G230300--Sobic007G208200 Sobic003G149600 Sobic003G149600 Sobic010G230300--Sobic003G149600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.