Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G166900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P8W4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g38940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G044700 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G094900 - -
3 Sobic.010G131950 - -
4 Sobic.004G065600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Cinnamoyl-CoA reductase CCR1 (At)(PubMedID : 27208977)@cinnamoyl CoA reductase, putative, expressed -
5 Sobic.003G364400 Ferredoxin-6 (Zm)(PubMedID : 27208977)@2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
6 Sobic.007G219000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G173300 spotted leaf 11, putative, expressed -
8 Sobic.002G322600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G283000 expressed protein -
10 Sobic.010G036100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.010G040700 transferase family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G165800 Protein kinase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G446500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G306400 BTB1 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed -
15 Sobic.009G204700 light repressible receptor protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.007G224700 expressed protein -
17 Sobic.006G236900 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
18 Sobic.002G259900 expressed protein -
19 Sobic.006G138850 - -
20 Sobic.009G003800 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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