Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G208900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VU20
Pfam -
Panther DB PTHR33476 PTHR33476:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10890 : myosin heavy chain-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g43990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051602
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G113890.1 , HORVU7Hr1G113890.3 , HORVU7Hr1G113890.2 , HORVU7Hr1G113890.4
Wheat TraesCS7B02G418800 , TraesCS7A02G509100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G046100 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G427900 wound-induced protein WI12, putative, expressed -
3 Sobic.009G067501 - -
4 Sobic.003G034500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
5 Sobic.007G136700 YGL010w, putative, expressed -
6 Sobic.007G054100 stress-induced protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G107500 - -
8 Sobic.005G090600 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
9 Sobic.001G420700 clathrin assembly protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G065800 - -
11 Sobic.010G045600 G-patch domain containing protein, expressed K12840: RBM17, splicing factor 45
12 Sobic.001G247400 plant-specific domain TIGR01615 family protein, expressed -
13 Sobic.009G137800 expressed protein -
14 Sobic.005G229400 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G181500 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10880: DNA-repair protein XRCC3
16 Sobic.008G042500 expressed protein -
17 Sobic.007G090427 - -
18 Sobic.002G430500 phospholipase C, putative, expressed K05857: phosphatidylinositol phospholipase C, delta
19 Sobic.004G153600 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
20 Sobic.006G256100 SWIB/MDM2 domain containing protein, expressed K15223: UAF30, upstream activation factor subunit UAF30


Gene co-expression network
sample Sobic010G208900 Sobic010G208900 Sobic005G046100 Sobic005G046100 Sobic010G208900--Sobic005G046100 Sobic002G427900 Sobic002G427900 Sobic010G208900--Sobic002G427900 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic010G208900--Sobic009G067501 Sobic003G034500 Sobic003G034500 Sobic010G208900--Sobic003G034500 Sobic007G136700 Sobic007G136700 Sobic010G208900--Sobic007G136700 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic010G208900--Sobic007G054100 Sobic009G107500 Sobic009G107500 Sobic010G208900--Sobic009G107500 Sobic005G090600 Sobic005G090600 Sobic010G208900--Sobic005G090600 Sobic001G420700 Sobic001G420700 Sobic010G208900--Sobic001G420700 Sobic005G167300 Sobic005G167300 Sobic005G046100--Sobic005G167300 Sobic004G150400 Sobic004G150400 Sobic005G046100--Sobic004G150400 Sobic005G046100--Sobic001G420700 Sobic006G109300 Sobic006G109300 Sobic005G046100--Sobic006G109300 Sobic004G198000 Sobic004G198000 Sobic005G046100--Sobic004G198000 Sobic010G055500 Sobic010G055500 Sobic005G046100--Sobic010G055500 Sobic009G137800 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Octagon: transcription factors


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