Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G181200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QJL2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G082000 expressed protein -
2 Sobic.009G236700 DUF1645 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G266100 endoglucanase, putative, expressed -
4 Sobic.005G138900 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
5 Sobic.004G327900 expressed protein -
6 Sobic.007G213200 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
7 Sobic.007G009900 - -
8 Sobic.002G241900 GPI-anchored protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G176900 proton pump interactor, putative, expressed -
10 Sobic.001G486800 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G084800 expressed protein -
12 Sobic.009G037700 signal recognition particle receptor, putative, expressed K13431: signal recognition particle receptor subunit alpha
13 Sobic.001G123400 expressed protein -
14 Sobic.002G255800 expressed protein -
15 Sobic.003G048300 - -
16 Sobic.004G200100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G218100 expressed protein -
18 Sobic.001G332400 DUF1336 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G230200 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
20 Sobic.003G122900 splicing factor 3 subunit 1, putative, expressed K12825: SF3A1, splicing factor 3A subunit 1


Gene co-expression network
sample Sobic001G181200 Sobic001G181200 Sobic004G082000 Sobic004G082000 Sobic001G181200--Sobic004G082000 Sobic009G236700 Sobic009G236700 Sobic001G181200--Sobic009G236700 Sobic010G266100 Sobic010G266100 Sobic001G181200--Sobic010G266100 Sobic005G138900 Sobic005G138900 Sobic001G181200--Sobic005G138900 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic001G181200--Sobic004G327900 Sobic007G213200 Sobic007G213200 Sobic001G181200--Sobic007G213200 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic001G181200--Sobic007G009900 Sobic002G241900 Sobic002G241900 Sobic001G181200--Sobic002G241900 Sobic002G176900 Sobic002G176900 Sobic001G181200--Sobic002G176900 Sobic004G082000--Sobic009G236700 Sobic004G082000--Sobic005G138900 Sobic004G082000--Sobic007G213200 Sobic004G082000--Sobic002G241900 Sobic005G160900 Sobic005G160900 Sobic004G082000--Sobic005G160900 Sobic004G082000--Sobic001G181200 Sobic004G082000--Sobic010G266100 Sobic003G122900 Sobic003G122900 Sobic004G082000--Sobic003G122900 Sobic006G218100 Sobic006G218100 Sobic004G082000--Sobic006G218100 Sobic009G236700--Sobic004G082000 Sobic009G236700--Sobic007G213200 Sobic009G236700--Sobic005G138900 Sobic003G084800 Sobic003G084800 Sobic009G236700--Sobic003G084800 Sobic001G042400 Sobic001G042400 Sobic009G236700--Sobic001G042400 Sobic009G236700--Sobic010G266100 Sobic009G236700--Sobic002G241900 Sobic010G256433 Sobic010G256433 Sobic009G236700--Sobic010G256433 Sobic009G236700--Sobic005G160900 Sobic010G266100--Sobic007G213200 Sobic010G266100--Sobic002G176900 Sobic010G266100--Sobic004G082000 Sobic010G266100--Sobic006G218100 Sobic003G270700 Sobic003G270700 Sobic010G266100--Sobic003G270700 Sobic010G266100--Sobic009G236700 Sobic010G266100--Sobic002G241900 Sobic010G096500 Sobic010G096500 Sobic010G266100--Sobic010G096500 Sobic007G184300 Sobic007G184300 Sobic010G266100--Sobic007G184300 Sobic005G138900--Sobic004G082000 Sobic005G138900--Sobic002G241900 Sobic005G138900--Sobic007G213200 Sobic005G138900--Sobic009G236700 Sobic005G138900--Sobic006G218100 Sobic005G138900--Sobic005G160900 Sobic005G017400 Sobic005G017400 Sobic005G138900--Sobic005G017400 Sobic005G138900--Sobic003G122900 Sobic005G138900--Sobic007G184300 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic004G327900--Sobic005G106700 Sobic004G234000 Sobic004G234000 Sobic004G327900--Sobic004G234000 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G327900--Sobic001G123400 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic004G327900--Sobic004G200100 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic004G327900--Sobic009G212900 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic004G327900--Sobic003G106800 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic004G327900--Sobic010G093200 Sobic005G014500 Sobic005G014500 Sobic004G327900--Sobic005G014500 Sobic004G327900--Sobic007G009900 Sobic007G213200--Sobic002G241900 Sobic007G213200--Sobic004G082000 Sobic007G213200--Sobic005G160900 Sobic007G213200--Sobic010G266100 Sobic007G213200--Sobic006G218100 Sobic007G213200--Sobic005G138900 Sobic007G213200--Sobic003G270700 Sobic007G213200--Sobic009G236700 Sobic007G213200--Sobic010G096500 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic007G009900--Sobic010G103400 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic008G104900 Sobic007G009900--Sobic001G123400 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic007G009900--Sobic002G408400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic007G009900--Sobic003G370800 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic001G486800 Sobic007G009900--Sobic009G212900 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic008G057200 Sobic007G009900--Sobic004G200100 Sobic002G241900--Sobic007G213200 Sobic002G241900--Sobic005G160900 Sobic002G241900--Sobic003G122900 Sobic002G241900--Sobic005G138900 Sobic002G241900--Sobic004G082000 Sobic002G241900--Sobic003G270700 Sobic002G241900--Sobic010G096500 Sobic006G208300 Sobic006G208300 Sobic002G241900--Sobic006G208300 Sobic002G241900--Sobic007G184300 Sobic002G176900--Sobic010G266100 Sobic001G251500 Sobic001G251500 Sobic002G176900--Sobic001G251500 Sobic005G023100 Sobic005G023100 Sobic002G176900--Sobic005G023100 Sobic003G374400 Sobic003G374400 Sobic002G176900--Sobic003G374400 Sobic002G176900--Sobic006G218100 Sobic002G176900--Sobic007G213200 Sobic003G002900 Sobic003G002900 Sobic002G176900--Sobic003G002900 Sobic002G176900--Sobic005G138900 Sobic001G536200 Sobic001G536200 Sobic002G176900--Sobic001G536200
Octagon: transcription factors


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