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Transcriptome id Sobic.001G212350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6P1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G089500 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor 9, putative, expressed K14486: K14486, auxin response factor
2 Sobic.004G251300 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
3 Sobic.009G027350 - -
4 Sobic.004G042200 OsFBO8 - F-box and other domain containing protein, expressed K12115: clock-associated PAS protein ZTL
5 Sobic.006G145200 expressed protein -
6 Sobic.003G122500 RNA binding protein, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
7 Sobic.006G031800 - -
8 Sobic.010G143800 expressed protein -
9 Sobic.001G081200 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
10 Sobic.001G049500 - K11594: DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X
11 Sobic.001G222250 - -
12 Sobic.001G122832 - K13414: mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1
13 Sobic.003G162100 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G144950 - -
15 Sobic.006G043901 - -
16 Sobic.003G168100 BZIP protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G212300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@myosin-2 heavy chain, non muscle, putative, expressed -
18 Sobic.003G043300 early fruit mRNA, putative, expressed -
19 Sobic.007G207500 expressed protein -
20 Sobic.009G123766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G212350 Sobic001G212350 Sobic006G089500 Sobic006G089500 Sobic001G212350--Sobic006G089500 Sobic004G251300 Sobic004G251300 Sobic001G212350--Sobic004G251300 Sobic009G027350 Sobic009G027350 Sobic001G212350--Sobic009G027350 Sobic004G042200 Sobic004G042200 Sobic001G212350--Sobic004G042200 Sobic006G145200 Sobic006G145200 Sobic001G212350--Sobic006G145200 Sobic003G122500 Sobic003G122500 Sobic001G212350--Sobic003G122500 Sobic006G031800 Sobic006G031800 Sobic001G212350--Sobic006G031800 Sobic010G143800 Sobic010G143800 Sobic001G212350--Sobic010G143800 Sobic001G081200 Sobic001G081200 Sobic001G212350--Sobic001G081200 Sobic001G420400 Sobic001G420400 Sobic006G089500--Sobic001G420400 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic006G089500--Sobic009G215500 Sobic006G089500--Sobic004G042200 Sobic006G089500--Sobic006G031800 Sobic004G147800 Sobic004G147800 Sobic006G089500--Sobic004G147800 Sobic001G217900 Sobic001G217900 Sobic006G089500--Sobic001G217900 Sobic001G062900 Sobic001G062900 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Octagon: transcription factors


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