Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G250600.1
Synonym Sb01g022160
Functional annotation DUF584 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5WM57
Pfam PF04520
Panther DB PTHR33083 PTHR33083:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15040 : Protein of unknown function, DUF584
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g27350.1 : DUF584 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006960
Brachypodium KQK11578
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G225201 - -
2 Sobic.004G011433 - -
3 Sobic.009G085300 - -
4 Sobic.003G194300 50S ribosomal protein, putative, expressed K02914: RP-L34, MRPL34, large subunit ribosomal protein L34
5 Sobic.003G410300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@zinc-finger protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G049900 MYB family transcription factor, putative, expressed -
7 Sobic.010G039000 expressed protein -
8 Sobic.001G504500 expressed protein -
9 Sobic.009G140900 expressed protein -
10 Sobic.003G027600 xylosyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.002G034750 - -
12 Sobic.005G170000 expressed protein -
13 Sobic.002G345000 expressed protein -
14 Sobic.004G100100 expressed protein -
15 Sobic.002G212300 - -
16 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
17 Sobic.008G006000 expressed protein -
18 Sobic.007G077532 - K08597: SENP8, NEDP1, sentrin-specific protease 8
19 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G013200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G250600 Sobic001G250600 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic001G250600--Sobic010G225201 Sobic004G011433 Sobic004G011433 Sobic001G250600--Sobic004G011433 Sobic009G085300 Sobic009G085300 Sobic001G250600--Sobic009G085300 Sobic003G194300 Sobic003G194300 Sobic001G250600--Sobic003G194300 Sobic003G410300 Sobic003G410300 Sobic001G250600--Sobic003G410300 Sobic007G049900 Sobic007G049900 Sobic001G250600--Sobic007G049900 Sobic010G039000 Sobic010G039000 Sobic001G250600--Sobic010G039000 Sobic001G504500 Sobic001G504500 Sobic001G250600--Sobic001G504500 Sobic009G140900 Sobic009G140900 Sobic001G250600--Sobic009G140900 Sobic002G034750 Sobic002G034750 Sobic010G225201--Sobic002G034750 Sobic010G225201--Sobic010G039000 Sobic010G225201--Sobic001G504500 Sobic008G006000 Sobic008G006000 Sobic010G225201--Sobic008G006000 Sobic010G255900 Sobic010G255900 Sobic010G225201--Sobic010G255900 Sobic002G397900 Sobic002G397900 Sobic010G225201--Sobic002G397900 Sobic004G100100 Sobic004G100100 Sobic010G225201--Sobic004G100100 Sobic005G170000 Sobic005G170000 Sobic010G225201--Sobic005G170000 Sobic007G219500 Sobic007G219500 Sobic010G225201--Sobic007G219500 Sobic004G011433--Sobic010G039000 Sobic004G011433--Sobic010G225201 Sobic004G011433--Sobic001G250600 Sobic004G106700 Sobic004G106700 Sobic004G011433--Sobic004G106700 Sobic002G345000 Sobic002G345000 Sobic004G011433--Sobic002G345000 Sobic004G011433--Sobic002G034750 Sobic010G194200 Sobic010G194200 Sobic004G011433--Sobic010G194200 Sobic001G451901 Sobic001G451901 Sobic004G011433--Sobic001G451901 Sobic002G335400 Sobic002G335400 Sobic004G011433--Sobic002G335400 Sobic009G085300--Sobic003G410300 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic009G085300--Sobic001G453600 Sobic009G044700 Sobic009G044700 Sobic009G085300--Sobic009G044700 Sobic010G145100 Sobic010G145100 Sobic009G085300--Sobic010G145100 Sobic009G085300--Sobic007G049900 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic009G085300--Sobic006G162400 Sobic006G079800 Sobic006G079800 Sobic009G085300--Sobic006G079800 Sobic005G076800 Sobic005G076800 Sobic009G085300--Sobic005G076800 Sobic001G398200 Sobic001G398200 Sobic009G085300--Sobic001G398200 Sobic010G250000 Sobic010G250000 Sobic003G194300--Sobic010G250000 Sobic001G167500 Sobic001G167500 Sobic003G194300--Sobic001G167500 Sobic003G388700 Sobic003G388700 Sobic003G194300--Sobic003G388700 Sobic009G218000 Sobic009G218000 Sobic003G194300--Sobic009G218000 Sobic007G140100 Sobic007G140100 Sobic003G194300--Sobic007G140100 Sobic001G309200 Sobic001G309200 Sobic003G194300--Sobic001G309200 Sobic008G118300 Sobic008G118300 Sobic003G194300--Sobic008G118300 Sobic001G286100 Sobic001G286100 Sobic003G194300--Sobic001G286100 Sobic003G113400 Sobic003G113400 Sobic003G194300--Sobic003G113400 Sobic007G092400 Sobic007G092400 Sobic003G410300--Sobic007G092400 Sobic003G410300--Sobic009G085300 Sobic003G410300--Sobic009G044700 Sobic003G410300--Sobic002G034750 Sobic003G008000 Sobic003G008000 Sobic003G410300--Sobic003G008000 Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic003G410300--Sobic010G104600 Sobic003G410300--Sobic001G453600 Sobic002G243300 Sobic002G243300 Sobic003G410300--Sobic002G243300 Sobic004G135366 Sobic004G135366 Sobic003G410300--Sobic004G135366 Sobic007G049900--Sobic001G453600 Sobic007G049900--Sobic006G162400 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic007G049900--Sobic002G414800 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic007G049900--Sobic001G387300 Sobic007G049900--Sobic009G218000 Sobic008G011800 Sobic008G011800 Sobic007G049900--Sobic008G011800 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic007G049900--Sobic009G046900 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic007G049900--Sobic002G239400 Sobic007G049900--Sobic010G225201 Sobic010G039000--Sobic010G225201 Sobic009G050000 Sobic009G050000 Sobic010G039000--Sobic009G050000 Sobic009G077100 Sobic009G077100 Sobic010G039000--Sobic009G077100 Sobic010G039000--Sobic009G218000 Sobic010G039000--Sobic010G194200 Sobic010G039000--Sobic002G345000 Sobic010G039000--Sobic004G011433 Sobic010G039000--Sobic007G219500 Sobic001G031800 Sobic001G031800 Sobic010G039000--Sobic001G031800 Sobic001G504500--Sobic001G453600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic001G504500--Sobic002G389600 Sobic001G024400 Sobic001G024400 Sobic001G504500--Sobic001G024400 Sobic004G349450 Sobic004G349450 Sobic001G504500--Sobic004G349450 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic001G504500--Sobic010G202200 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G504500--Sobic003G024100 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic001G504500--Sobic001G133400 Sobic001G504500--Sobic002G414800 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic001G504500--Sobic007G039200 Sobic003G032400 Sobic003G032400 Sobic009G140900--Sobic003G032400 Sobic006G158332 Sobic006G158332 Sobic009G140900--Sobic006G158332 Sobic001G464400 Sobic001G464400 Sobic009G140900--Sobic001G464400 Sobic006G203600 Sobic006G203600 Sobic009G140900--Sobic006G203600 Sobic001G095000 Sobic001G095000 Sobic009G140900--Sobic001G095000 Sobic001G025700 Sobic001G025700 Sobic009G140900--Sobic001G025700 Sobic008G111800 Sobic008G111800 Sobic009G140900--Sobic008G111800 Sobic007G032000 Sobic007G032000 Sobic009G140900--Sobic007G032000 Sobic009G140900--Sobic010G225201
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.