Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G305000.2,Sobic.001G305000.1
Synonym
Functional annotation stress responsive protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QM06
Pfam -
Panther DB PTHR31257 PTHR31257:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39050 : hydroxyproline-rich glycoprotein family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g21040.2 : stress responsive protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK21868
Barley HORVU4Hr1G051320.1 , HORVU4Hr1G051320.3 , HORVU4Hr1G051320.2 , HORVU4Hr1G051320.4
Wheat TraesCS4D02G175900 , TraesCS4D02G175900 , TraesCS4A02G130800 , TraesCS4A02G130800 , TraesCS4A02G130800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G155701 - -
2 Sobic.003G023732 - -
3 Sobic.005G018600 - -
4 Sobic.008G082000 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G180950 - -
6 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G267100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
8 Sobic.007G196700 expressed protein -
9 Sobic.008G006700 expressed protein -
10 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
11 Sobic.006G070564 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
12 Sobic.002G078200 - -
13 Sobic.004G020200 expressed protein -
14 Sobic.008G071300 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L
15 Sobic.001G230801 - -
16 Sobic.005G170400 OsFBDUF58 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G110600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G279200 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
19 Sobic.004G038500 cyclin-related protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G172100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G305000 Sobic001G305000 Sobic010G155701 Sobic010G155701 Sobic001G305000--Sobic010G155701 Sobic003G023732 Sobic003G023732 Sobic001G305000--Sobic003G023732 Sobic005G018600 Sobic005G018600 Sobic001G305000--Sobic005G018600 Sobic008G082000 Sobic008G082000 Sobic001G305000--Sobic008G082000 Sobic003G180950 Sobic003G180950 Sobic001G305000--Sobic003G180950 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic001G305000--Sobic001G039100 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic001G305000--Sobic006G267100 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic001G305000--Sobic007G196700 Sobic008G006700 Sobic008G006700 Sobic001G305000--Sobic008G006700 Sobic010G155701--Sobic003G023732 Sobic010G155701--Sobic003G180950 Sobic005G170400 Sobic005G170400 Sobic010G155701--Sobic005G170400 Sobic010G155701--Sobic005G018600 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic010G155701--Sobic001G172100 Sobic010G111000 Sobic010G111000 Sobic010G155701--Sobic010G111000 Sobic002G078200 Sobic002G078200 Sobic010G155701--Sobic002G078200 Sobic001G232600 Sobic001G232600 Sobic010G155701--Sobic001G232600 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic010G155701--Sobic005G207700 Sobic003G023732--Sobic005G170400 Sobic003G023732--Sobic001G172100 Sobic003G023732--Sobic010G111000 Sobic003G023732--Sobic010G155701 Sobic003G023732--Sobic005G207700 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic003G023732--Sobic002G073600 Sobic002G283200 Sobic002G283200 Sobic003G023732--Sobic002G283200 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic003G023732--Sobic004G042501 Sobic003G019450 Sobic003G019450 Sobic003G023732--Sobic003G019450 Sobic003G042800 Sobic003G042800 Sobic005G018600--Sobic003G042800 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic005G018600--Sobic006G272400 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G018600--Sobic008G102850 Sobic005G044600 Sobic005G044600 Sobic005G018600--Sobic005G044600 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G018600--Sobic004G158100 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G018600--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic005G018600--Sobic007G103000 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G018600--Sobic005G122100 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic005G018600--Sobic005G065300 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic008G082000--Sobic007G063800 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic008G082000--Sobic010G038300 Sobic007G127800 Sobic007G127800 Sobic008G082000--Sobic007G127800 Sobic008G082000--Sobic003G023732 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic008G082000--Sobic005G202901 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic008G082000--Sobic004G014200 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic008G082000--Sobic006G070564 Sobic008G082000--Sobic001G172100 Sobic008G082000--Sobic002G078200 Sobic003G180950--Sobic010G155701 Sobic003G180950--Sobic003G023732 Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic003G180950--Sobic010G104600 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic003G180950--Sobic006G093600 Sobic003G180950--Sobic001G172100 Sobic003G180950--Sobic005G170400 Sobic004G189000 Sobic004G189000 Sobic003G180950--Sobic004G189000 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic003G180950--Sobic002G389600 Sobic003G180950--Sobic001G232600 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic001G039100--Sobic002G404600 Sobic001G039100--Sobic007G196700 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic001G039100--Sobic002G381500 Sobic002G308900 Sobic002G308900 Sobic001G039100--Sobic002G308900 Sobic009G110600 Sobic009G110600 Sobic001G039100--Sobic009G110600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic001G039100--Sobic006G105100 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic001G039100--Sobic002G380300 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic001G039100--Sobic001G414650 Sobic004G290500 Sobic004G290500 Sobic001G039100--Sobic004G290500 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic006G267100--Sobic008G071300 Sobic006G267100--Sobic001G414650 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic006G267100--Sobic002G340600 Sobic003G114600 Sobic003G114600 Sobic006G267100--Sobic003G114600 Sobic006G267100--Sobic002G283200 Sobic006G267100--Sobic006G105100 Sobic006G267100--Sobic004G042501 Sobic006G267100--Sobic002G380300 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic006G267100--Sobic003G290500 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic007G196700--Sobic001G143700 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic007G196700--Sobic005G148000 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic007G196700--Sobic001G240700 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic007G196700--Sobic005G040100 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic007G196700--Sobic002G097300 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic007G196700--Sobic002G006200 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic007G196700--Sobic008G138400 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic007G196700--Sobic005G189100 Sobic007G196700--Sobic009G110600 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic008G006700--Sobic010G058300 Sobic006G171600 Sobic006G171600 Sobic008G006700--Sobic006G171600 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic008G006700--Sobic004G045632 Sobic004G279200 Sobic004G279200 Sobic008G006700--Sobic004G279200 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic008G006700--Sobic010G266600 Sobic010G263400 Sobic010G263400 Sobic008G006700--Sobic010G263400 Sobic008G006700--Sobic001G414650 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic008G006700--Sobic009G202000 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic008G006700--Sobic007G144100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.