Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G413500.1
Synonym Sb01g038955
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QP20
Pfam -
Panther DB PTHR20939 PTHR20939:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g17410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001907 , Zm00025a014434
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G101950.1 , HORVU5Hr1G025070.1
Wheat TraesCS4D02G201900 , TraesCS4D02G201900 , TraesCS4D02G201900 , TraesCS4D02G201900 , TraesCS4A02G103200 , TraesCS4B02G200900 , TraesCS4B02G200900 , TraesCS4B02G200900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G083900 C-5 cytosine-specific DNA methylase, putative, expressed K00558: DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1
2 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
3 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
4 Sobic.004G240800 protein kinase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G497300 protein kinase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G023900 expressed protein -
7 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
8 Sobic.004G145500 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G205600 bromodomain domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G196700 expressed protein -
12 Sobic.002G399100 zinc finger, RING-type, putative, expressed K15688: E3 ubiquitin-protein ligase MUL1
13 Sobic.002G248400 ENT domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
16 Sobic.002G144933 - -
17 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
18 Sobic.009G000500 pex14, putative, expressed K13343: peroxin-14
19 Sobic.005G045300 PX domain containing protein, putative, expressed K17925: sorting nexin-13
20 Sobic.008G054500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G413500 Sobic001G413500 Sobic009G083900 Sobic009G083900 Sobic001G413500--Sobic009G083900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G413500--Sobic008G173900 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G413500--Sobic002G157000 Sobic004G240800 Sobic004G240800 Sobic001G413500--Sobic004G240800 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic001G413500--Sobic001G497300 Sobic005G023900 Sobic005G023900 Sobic001G413500--Sobic005G023900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic001G413500--Sobic003G200200 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic001G413500--Sobic004G145500 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G413500--Sobic003G268300 Sobic009G083900--Sobic001G413500 Sobic009G083900--Sobic004G240800 Sobic009G083900--Sobic001G497300 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic009G083900--Sobic007G185900 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic009G083900--Sobic009G000500 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic009G083900--Sobic004G196700 Sobic009G083900--Sobic004G145500 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic009G083900--Sobic008G054500 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic009G083900--Sobic005G045300 Sobic008G173900--Sobic002G157000 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic008G173900--Sobic002G144933 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic008G173900--Sobic001G420200 Sobic008G173900--Sobic003G268300 Sobic008G173900--Sobic008G054500 Sobic008G173900--Sobic003G200200 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic008G173900--Sobic001G274200 Sobic008G173900--Sobic001G413500 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic008G173900--Sobic007G096600 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic002G157000--Sobic002G248400 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic002G157000--Sobic002G320500 Sobic002G157000--Sobic003G200200 Sobic002G157000--Sobic001G420200 Sobic002G157000--Sobic008G173900 Sobic002G157000--Sobic003G268300 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic002G157000--Sobic001G162300 Sobic003G108700 Sobic003G108700 Sobic002G157000--Sobic003G108700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G157000--Sobic001G094000 Sobic004G240800--Sobic001G413500 Sobic004G240800--Sobic009G083900 Sobic004G240800--Sobic001G497300 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic004G240800--Sobic002G133400 Sobic004G240800--Sobic005G023900 Sobic004G240800--Sobic004G145500 Sobic002G090800 Sobic002G090800 Sobic004G240800--Sobic002G090800 Sobic004G057400 Sobic004G057400 Sobic004G240800--Sobic004G057400 Sobic004G240800--Sobic002G157000 Sobic007G104800 Sobic007G104800 Sobic001G497300--Sobic007G104800 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic001G497300--Sobic001G512700 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic001G497300--Sobic002G006900 Sobic006G237400 Sobic006G237400 Sobic001G497300--Sobic006G237400 Sobic004G205600 Sobic004G205600 Sobic001G497300--Sobic004G205600 Sobic001G497300--Sobic001G413500 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic001G497300--Sobic008G047800 Sobic001G497300--Sobic005G023900 Sobic001G497300--Sobic002G157000 Sobic005G023900--Sobic002G157000 Sobic005G023900--Sobic003G200200 Sobic005G023900--Sobic001G413500 Sobic005G023900--Sobic001G497300 Sobic005G023900--Sobic002G006900 Sobic001G486300 Sobic001G486300 Sobic005G023900--Sobic001G486300 Sobic005G023900--Sobic003G268300 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic005G023900--Sobic007G065400 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic005G023900--Sobic009G210500 Sobic003G200200--Sobic002G157000 Sobic003G200200--Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic003G268300 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic007G096600 Sobic003G200200--Sobic002G248400 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic008G173900 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic003G200200--Sobic003G170100 Sobic004G145500--Sobic007G065400 Sobic004G145500--Sobic008G173900 Sobic004G145500--Sobic002G144933 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic004G145500--Sobic008G009700 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic004G145500--Sobic001G306900 Sobic004G145500--Sobic003G200200 Sobic004G145500--Sobic009G210500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic004G145500--Sobic010G136600 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic004G145500--Sobic001G241200 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic008G173900
Octagon: transcription factors


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