Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G083900.2,Sobic.009G083900.3
Synonym CMT2, Sb09g007390
Functional annotation C-5 cytosine-specific DNA methylase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R290 , A0A1Z5R1I9
Pfam PF00385 PF01426 PF00145
Panther DB PTHR10629 PTHR10629:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00558; DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1
Gene Ontology GO:0003682; chromatin binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19020 : chromomethylase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g13780.1 : C-5 cytosine-specific DNA methylase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK22267 , KQK22266
Barley HORVU4Hr1G058250.6 , HORVU4Hr1G058250.7 , HORVU4Hr1G058250.4 , HORVU4Hr1G058250.5 , HORVU4Hr1G058250.2 , HORVU4Hr1G058250.1 , HORVU4Hr1G058250.8 , HORVU4Hr1G058250.9 , HORVU4Hr1G058250.18 , HORVU4Hr1G058250.14 , HORVU4Hr1G058250.15 , HORVU4Hr1G058250.16 , HORVU4Hr1G058250.17 , HORVU4Hr1G058250.10 , HORVU4Hr1G058250.11 , HORVU4Hr1G058250.12 , HORVU4Hr1G058250.3 , HORVU4Hr1G058250.13
Wheat TraesCS4A02G102700 , TraesCS4A02G102700 , TraesCS4D02G202600 , TraesCS4D02G202600 , TraesCS4B02G201800 , TraesCS4B02G201800 , TraesCS4B02G201800 , TraesCS4B02G201800
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Rank Gene Function KEGG orthology
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11 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
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20 Sobic.007G217000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K13342: PEX5, peroxin-5


Gene co-expression network
sample Sobic009G083900 Sobic009G083900 Sobic001G413500 Sobic001G413500 Sobic009G083900--Sobic001G413500 Sobic004G240800 Sobic004G240800 Sobic009G083900--Sobic004G240800 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic009G083900--Sobic001G497300 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic009G083900--Sobic007G185900 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic009G083900--Sobic009G000500 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic009G083900--Sobic004G196700 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic009G083900--Sobic004G145500 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic009G083900--Sobic008G054500 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic009G083900--Sobic005G045300 Sobic001G413500--Sobic009G083900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G413500--Sobic008G173900 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G413500--Sobic002G157000 Sobic001G413500--Sobic004G240800 Sobic001G413500--Sobic001G497300 Sobic005G023900 Sobic005G023900 Sobic001G413500--Sobic005G023900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic001G413500--Sobic003G200200 Sobic001G413500--Sobic004G145500 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G413500--Sobic003G268300 Sobic004G240800--Sobic001G413500 Sobic004G240800--Sobic009G083900 Sobic004G240800--Sobic001G497300 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic004G240800--Sobic002G133400 Sobic004G240800--Sobic005G023900 Sobic004G240800--Sobic004G145500 Sobic002G090800 Sobic002G090800 Sobic004G240800--Sobic002G090800 Sobic004G057400 Sobic004G057400 Sobic004G240800--Sobic004G057400 Sobic004G240800--Sobic002G157000 Sobic007G104800 Sobic007G104800 Sobic001G497300--Sobic007G104800 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic001G497300--Sobic001G512700 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic001G497300--Sobic002G006900 Sobic006G237400 Sobic006G237400 Sobic001G497300--Sobic006G237400 Sobic004G205600 Sobic004G205600 Sobic001G497300--Sobic004G205600 Sobic001G497300--Sobic001G413500 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic001G497300--Sobic008G047800 Sobic001G497300--Sobic005G023900 Sobic001G497300--Sobic002G157000 Sobic007G185900--Sobic004G196700 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic007G185900--Sobic002G157300 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic007G185900--Sobic007G078000 Sobic010G260500 Sobic010G260500 Sobic007G185900--Sobic010G260500 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic007G185900--Sobic002G313300 Sobic007G185900--Sobic008G054500 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic007G185900--Sobic003G397800 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic007G185900--Sobic005G149500 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic007G185900--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic009G000500--Sobic004G031700 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic009G000500--Sobic003G445400 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic009G000500--Sobic002G320500 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic009G000500--Sobic006G128900 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic009G000500--Sobic006G133800 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic009G000500--Sobic001G090400 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic009G000500--Sobic003G307000 Sobic009G000500--Sobic008G173900 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic009G000500--Sobic001G206100 Sobic004G196700--Sobic007G185900 Sobic004G196700--Sobic007G078000 Sobic004G196700--Sobic005G149500 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic004G196700--Sobic007G137900 Sobic004G196700--Sobic002G157300 Sobic004G196700--Sobic003G187400 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic004G196700--Sobic001G477800 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic004G196700--Sobic006G082600 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic004G196700--Sobic009G040700 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic004G145500--Sobic007G065400 Sobic004G145500--Sobic008G173900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic004G145500--Sobic002G144933 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic004G145500--Sobic008G009700 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic004G145500--Sobic001G306900 Sobic004G145500--Sobic003G200200 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic004G145500--Sobic009G210500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic004G145500--Sobic010G136600 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic004G145500--Sobic001G241200 Sobic008G054500--Sobic008G173900 Sobic008G054500--Sobic003G200200 Sobic008G054500--Sobic003G268300 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic008G054500--Sobic002G248400 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic008G054500--Sobic008G078100 Sobic008G054500--Sobic002G157000 Sobic008G054500--Sobic003G445400 Sobic008G054500--Sobic007G185900 Sobic008G054500--Sobic003G397800 Sobic005G045300--Sobic001G512700 Sobic003G408500 Sobic003G408500 Sobic005G045300--Sobic003G408500 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic005G045300--Sobic010G129200 Sobic005G045300--Sobic003G445400 Sobic009G166300 Sobic009G166300 Sobic005G045300--Sobic009G166300 Sobic005G045300--Sobic004G031700 Sobic005G045300--Sobic006G128900 Sobic005G045300--Sobic002G006900 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic005G045300--Sobic008G024600
Octagon: transcription factors


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