Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G442600.1
Synonym Sb01g041590
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WRL7
Pfam -
Panther DB PTHR37232 PTHR37232:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55820 : Fasciclin-like arabinogalactan family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g13490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052943
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G064540.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G097000 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.001G446500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
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5 Sobic.010G083300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
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7 Sobic.010G198800 expressed protein -
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10 Sobic.010G198700 expressed protein -
11 Sobic.008G158732 - -
12 Sobic.001G420600 - -
13 Sobic.001G449200 thaumatin family domain containing protein, expressed -
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15 Sobic.004G229400 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G354200 transporter family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G219400 oxidoreductase/ transition metal ion binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G383050 - -
19 Sobic.003G399700 LTPL38 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.002G428400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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