Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G205600.2,Sobic.002G205600.1,Sobic.002G205600.3
Synonym Sb02g025030
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W547 , A0A1B6QCM7
Pfam PF04484
Panther DB PTHR31807 PTHR31807:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19570 : Family of unknown function (DUF566)
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g25500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047055
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G064220.15 , HORVU5Hr1G064220.14 , HORVU5Hr1G064220.16 , HORVU5Hr1G064220.10 , HORVU5Hr1G064220.13 , HORVU5Hr1G064220.12 , HORVU5Hr1G064220.8 , HORVU5Hr1G064220.1 , HORVU5Hr1G064220.3 , HORVU5Hr1G064220.2 , HORVU5Hr1G064220.5 , HORVU5Hr1G064220.4 , HORVU5Hr1G064220.7 , HORVU5Hr1G064220.6 , HORVU5Hr1G064220.9
Wheat TraesCS5B02G221400 , TraesCS5B02G221400 , TraesCS5A02G222400 , TraesCS5D02G230200 , TraesCS5D02G230200
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G039400 cation efflux family protein, putative, expressed K14696: SLC30A9, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9
2 Sobic.001G255800 CPuORF15 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
3 Sobic.008G171400 phosphonate metabolism protein-related, putative, expressed -
4 Sobic.001G301200 pattern formation protein EMB30, putative, expressed K18443: golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1
5 Sobic.002G291400 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase, putative, expressed K00767: nadC, nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)
6 Sobic.003G316200 transmembrane protein 49, putative, expressed -
7 Sobic.003G241700 SET domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G253300 phosphofructokinase, putative, expressed K00850: pfkA, 6-phosphofructokinase 1
9 Sobic.005G018800 expressed protein -
10 Sobic.002G227500 protein transport protein, putative, expressed K14006: protein transport protein SEC23
11 Sobic.006G021700 expressed protein K17600: vacuolar protein sorting-associated protein 54
12 Sobic.001G537100 dehydrogenase-phosphopantetheinyltransferase, putative, expressed K06133: LYS5, 4'-phosphopantetheinyl transferase
13 Sobic.003G213400 expressed protein -
14 Sobic.007G172700 ECT5, putative, expressed -
15 Sobic.001G435400 vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed K02154: ATPeV0A, V-type H+-transporting ATPase subunit a
16 Sobic.002G426300 actin, putative, expressed K17260: ACTR2, actin-related protein 2
17 Sobic.003G296900 expressed protein -
18 Sobic.001G283600 NTMC2Type1.2 protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G255932 - -
20 Sobic.003G200800 vacuolar ATP synthase subunit d, putative, expressed K02146: ATPeV0D, V-type H+-transporting ATPase subunit d


Gene co-expression network
sample Sobic002G205600 Sobic002G205600 Sobic006G039400 Sobic006G039400 Sobic002G205600--Sobic006G039400 Sobic001G255800 Sobic001G255800 Sobic002G205600--Sobic001G255800 Sobic008G171400 Sobic008G171400 Sobic002G205600--Sobic008G171400 Sobic001G301200 Sobic001G301200 Sobic002G205600--Sobic001G301200 Sobic002G291400 Sobic002G291400 Sobic002G205600--Sobic002G291400 Sobic003G316200 Sobic003G316200 Sobic002G205600--Sobic003G316200 Sobic003G241700 Sobic003G241700 Sobic002G205600--Sobic003G241700 Sobic001G253300 Sobic001G253300 Sobic002G205600--Sobic001G253300 Sobic005G018800 Sobic005G018800 Sobic002G205600--Sobic005G018800 Sobic006G093300 Sobic006G093300 Sobic006G039400--Sobic006G093300 Sobic001G405600 Sobic001G405600 Sobic006G039400--Sobic001G405600 Sobic003G296900 Sobic003G296900 Sobic006G039400--Sobic003G296900 Sobic001G237600 Sobic001G237600 Sobic006G039400--Sobic001G237600 Sobic003G182300 Sobic003G182300 Sobic006G039400--Sobic003G182300 Sobic010G230600 Sobic010G230600 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Octagon: transcription factors


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