Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G248500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5X3X4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G393332 - -
2 Sobic.010G015900 transcriptional corepressor SEUSS, putative, expressed -
3 Sobic.005G188300 expressed protein -
4 Sobic.003G351401 - -
5 Sobic.003G122000 BCAS2 protein, putative, expressed K12861: pre-mRNA-splicing factor SPF27
6 Sobic.010G089800 expressed protein -
7 Sobic.006G169500 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K01444: AGA, N4-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase
8 Sobic.005G145800 - -
9 Sobic.002G340200 expressed protein -
10 Sobic.003G388000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03350: APC3, anaphase-promoting complex subunit 3
11 Sobic.009G176366 - -
12 Sobic.010G135250 - -
13 Sobic.010G233000 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
14 Sobic.004G006600 transcription factor jumonji, putative, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
15 Sobic.001G091200 - -
16 Sobic.003G188300 expressed protein -
17 Sobic.001G484200 "RGA1/D1(Ortholog in rice:Ashikari, 1999)"(PubMedID : 31659848)@G-protein alpha subunit, putative, expressed K04640: guanine nucleotide-binding protein subunit alpha, other
18 Sobic.001G475100 expressed protein -
19 Sobic.001G312400 - -
20 Sobic.001G528500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G248500 Sobic002G248500 Sobic002G393332 Sobic002G393332 Sobic002G248500--Sobic002G393332 Sobic010G015900 Sobic010G015900 Sobic002G248500--Sobic010G015900 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic002G248500--Sobic005G188300 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic002G248500--Sobic003G351401 Sobic003G122000 Sobic003G122000 Sobic002G248500--Sobic003G122000 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic002G248500--Sobic010G089800 Sobic006G169500 Sobic006G169500 Sobic002G248500--Sobic006G169500 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic002G248500--Sobic005G145800 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic002G248500--Sobic002G340200 Sobic001G480550 Sobic001G480550 Sobic002G393332--Sobic001G480550 Sobic009G113100 Sobic009G113100 Sobic002G393332--Sobic009G113100 Sobic009G132600 Sobic009G132600 Sobic002G393332--Sobic009G132600 Sobic006G156801 Sobic006G156801 Sobic002G393332--Sobic006G156801 Sobic002G142700 Sobic002G142700 Sobic002G393332--Sobic002G142700 Sobic001G004100 Sobic001G004100 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Octagon: transcription factors


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