Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G394300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QFU7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015308
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G017700 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G281400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16281: RING-H2 zinc finger protein RHA1
3 Sobic.001G188700 OST3/OST6 family protein, putative, expressed K12669: OST3, oligosaccharyltransferase complex subunit gamma
4 Sobic.010G079800 expressed protein -
5 Sobic.008G168700 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G181700 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17794: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM23
7 Sobic.009G232500 expressed protein -
8 Sobic.009G070300 - -
9 Sobic.002G066901 - -
10 Sobic.008G008300 expressed protein -
11 Sobic.004G275100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.003G016400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.004G146200 MazG nucleotide pyrophosphohydrolase domain containing protein, expressed K16904: dCTP diphosphatase
14 Sobic.009G083600 OsCML18 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
15 Sobic.005G115400 - -
16 Sobic.007G031100 RNA polymerase II complex component SRB7, putative, expressed K15152: MED21, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
17 Sobic.001G279400 - -
18 Sobic.005G067400 - -
19 Sobic.009G187600 methyltransferase domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G267000 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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