Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G401800.2,Sobic.002G401800.4,Sobic.002G401800.1,Sobic.002G401800.3
Synonym NTRC
Functional annotation bifunctional thioredoxin reductase/thioredoxin, putative, expressed
UniProt A0A1B6QG02 , A0A1W0W7T1 , A0A1B6QG08
Pfam PF00085 PF00070
Panther DB PTHR22912 PTHR22912:SF48
NCBI CDD KOG0404; Thioredoxin reductase
KEGG Orthology K00384; trxB, thioredoxin reductase (NADPH)
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41680 : NADPH-dependent thioredoxin reductase C
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46410.1 : bifunctional thioredoxin reductase/thioredoxin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049022
Brachypodium KQK14870
Barley HORVU4Hr1G041270.1 , HORVU2Hr1G023170.8 , HORVU2Hr1G023170.3 , HORVU2Hr1G023170.2 , HORVU2Hr1G023170.1 , HORVU2Hr1G023170.7 , HORVU2Hr1G023170.6 , HORVU2Hr1G023170.5 , HORVU2Hr1G023170.4 , HORVU7Hr1G006340.1 , HORVU4Hr1G012430.1
Wheat TraesCS2A02G132200 , TraesCS2A02G132200 , TraesCS2B02G154700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G336200 OsClp6 - Putative Clp protease homologue, expressed K01358: clpP, ATP-dependent Clp protease, protease subunit
2 Sobic.008G073100 uncharacterized protein ycf45, putative, expressed -
3 Sobic.002G405100 elongation factor TS family protein, expressed K02357: tsf, elongation factor Ts
4 Sobic.004G012900 expressed protein -
5 Sobic.002G272100 expressed protein -
6 Sobic.005G110400 pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
7 Sobic.005G100300 OsClp12 - Putative Clp protease homologue, expressed -
8 Sobic.001G368500 ribosomal protein L6, putative, expressed K02933: RP-L6, MRPL6, large subunit ribosomal protein L6
9 Sobic.003G077400 peptidase M50 family protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G052400 rubredoxin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G233700 -(PubMedID : 26976818)@dicarboxylate transporter 2(PubMedID : 27016024)@citrate transporter, putative, expressed K03319: divalent anion:Na+ symporter, DASS family
12 Sobic.008G039600 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
13 Sobic.006G132000 glycine-rich protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G143500 aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, putative, expressed K02434: gatB, aspartyl-tRNA(Asn)/glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B
15 Sobic.010G035400 expressed protein -
16 Sobic.002G351600 prenyltransferase, putative, expressed K12501: homogentisate solanesyltransferase
17 Sobic.003G094350 - K01869: LARS, leucyl-tRNA synthetase
18 Sobic.006G106400 OsDegp5 - Putative Deg protease homologue, expressed -
19 Sobic.004G353100 -(PubMedID : 26976818)@phosphate/phosphate translocator, putative, expressed K15283: solute carrier family 35, member E1
20 Sobic.001G134700 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin


Gene co-expression network
sample Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic004G336200 Sobic004G336200 Sobic002G401800--Sobic004G336200 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic002G401800--Sobic008G073100 Sobic002G405100 Sobic002G405100 Sobic002G401800--Sobic002G405100 Sobic004G012900 Sobic004G012900 Sobic002G401800--Sobic004G012900 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic002G401800--Sobic002G272100 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic002G401800--Sobic005G110400 Sobic005G100300 Sobic005G100300 Sobic002G401800--Sobic005G100300 Sobic001G368500 Sobic001G368500 Sobic002G401800--Sobic001G368500 Sobic003G077400 Sobic003G077400 Sobic002G401800--Sobic003G077400 Sobic004G336200--Sobic002G401800 Sobic010G035400 Sobic010G035400 Sobic004G336200--Sobic010G035400 Sobic001G500600 Sobic001G500600 Sobic004G336200--Sobic001G500600 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic004G336200--Sobic003G387100 Sobic003G160800 Sobic003G160800 Sobic004G336200--Sobic003G160800 Sobic004G336200--Sobic008G073100 Sobic001G134700 Sobic001G134700 Sobic004G336200--Sobic001G134700 Sobic004G336200--Sobic005G110400 Sobic006G197300 Sobic006G197300 Sobic004G336200--Sobic006G197300 Sobic008G073100--Sobic005G110400 Sobic008G073100--Sobic001G368500 Sobic008G073100--Sobic002G401800 Sobic008G073100--Sobic003G387100 Sobic008G073100--Sobic004G336200 Sobic001G309300 Sobic001G309300 Sobic008G073100--Sobic001G309300 Sobic008G073100--Sobic003G077400 Sobic008G073100--Sobic002G272100 Sobic006G106400 Sobic006G106400 Sobic008G073100--Sobic006G106400 Sobic002G133900 Sobic002G133900 Sobic002G405100--Sobic002G133900 Sobic002G405100--Sobic005G100300 Sobic002G405100--Sobic002G401800 Sobic004G353100 Sobic004G353100 Sobic002G405100--Sobic004G353100 Sobic002G405100--Sobic010G035400 Sobic010G201600 Sobic010G201600 Sobic002G405100--Sobic010G201600 Sobic003G094350 Sobic003G094350 Sobic002G405100--Sobic003G094350 Sobic002G405100--Sobic004G336200 Sobic007G052400 Sobic007G052400 Sobic002G405100--Sobic007G052400 Sobic004G012900--Sobic007G052400 Sobic002G233700 Sobic002G233700 Sobic004G012900--Sobic002G233700 Sobic004G012900--Sobic002G401800 Sobic010G005500 Sobic010G005500 Sobic004G012900--Sobic010G005500 Sobic003G378600 Sobic003G378600 Sobic004G012900--Sobic003G378600 Sobic009G059300 Sobic009G059300 Sobic004G012900--Sobic009G059300 Sobic010G277600 Sobic010G277600 Sobic004G012900--Sobic010G277600 Sobic004G012900--Sobic003G387100 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic004G012900--Sobic008G171300 Sobic002G272100--Sobic002G401800 Sobic002G272100--Sobic008G073100 Sobic002G272100--Sobic001G368500 Sobic008G050400 Sobic008G050400 Sobic002G272100--Sobic008G050400 Sobic008G039600 Sobic008G039600 Sobic002G272100--Sobic008G039600 Sobic002G351600 Sobic002G351600 Sobic002G272100--Sobic002G351600 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic002G272100--Sobic002G267900 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic002G272100--Sobic001G083100 Sobic002G272100--Sobic005G110400 Sobic005G110400--Sobic008G073100 Sobic005G110400--Sobic001G368500 Sobic001G126300 Sobic001G126300 Sobic005G110400--Sobic001G126300 Sobic005G110400--Sobic002G401800 Sobic005G110400--Sobic004G336200 Sobic005G110400--Sobic003G387100 Sobic005G143500 Sobic005G143500 Sobic005G110400--Sobic005G143500 Sobic005G110400--Sobic003G077400 Sobic003G432500 Sobic003G432500 Sobic005G110400--Sobic003G432500 Sobic005G100300--Sobic002G405100 Sobic005G100300--Sobic002G133900 Sobic005G100300--Sobic010G201600 Sobic005G100300--Sobic003G094350 Sobic005G100300--Sobic003G160800 Sobic001G128600 Sobic001G128600 Sobic005G100300--Sobic001G128600 Sobic005G100300--Sobic002G401800 Sobic005G100300--Sobic001G134700 Sobic005G100300--Sobic004G353100 Sobic003G324700 Sobic003G324700 Sobic001G368500--Sobic003G324700 Sobic001G368500--Sobic005G110400 Sobic001G368500--Sobic003G432500 Sobic001G469933 Sobic001G469933 Sobic001G368500--Sobic001G469933 Sobic001G122400 Sobic001G122400 Sobic001G368500--Sobic001G122400 Sobic001G368500--Sobic008G073100 Sobic001G368500--Sobic002G401800 Sobic003G271900 Sobic003G271900 Sobic001G368500--Sobic003G271900 Sobic001G368500--Sobic005G143500 Sobic003G077400--Sobic001G469933 Sobic003G077400--Sobic008G073100 Sobic003G077400--Sobic005G110400 Sobic003G077400--Sobic004G012900 Sobic003G077400--Sobic001G368500 Sobic003G077400--Sobic002G401800 Sobic003G077400--Sobic003G387100 Sobic003G077400--Sobic003G160800 Sobic003G077400--Sobic004G336200
Octagon: transcription factors


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