Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G180300.1
Synonym Sb03g023720
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XMA3
Pfam PF09597
Panther DB PTHR34955 PTHR34955:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26800 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g19400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G208900 G-patch domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G427700 expressed protein -
3 Sobic.009G077700 hydrolase, NUDIX family, domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G257600 transcription initiation factor TFIID subunit 11, putative, expressed K03135: transcription initiation factor TFIID subunit 11
5 Sobic.010G101500 skp1 family, tetramerisation domain containing protein, expressed K03872: ELOC, elongin-C
6 Sobic.008G075900 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
7 Sobic.009G178100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
8 Sobic.001G204501 - -
9 Sobic.001G005900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G091900 -(PubMedID : 26320239)@HVA22, putative, expressed -
11 Sobic.001G460600 RING zinc finger protein-like, putative, expressed -
12 Sobic.010G103900 ribosomal protein L51, putative, expressed K17424: large subunit ribosomal protein L43
13 Sobic.001G048100 OsAPRL5 adenosine 5\'-phosphosulfate reductase-like OsAPRL5, expressed -
14 Sobic.001G157500 expressed protein -
15 Sobic.001G106700 expressed protein -
16 Sobic.005G029100 PP2A regulatory subunit TAP46, putative, expressed -
17 Sobic.003G216700 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
18 Sobic.009G174900 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K06689: UBE2D, UBC4, ubiquitin-conjugating enzyme E2 D
19 Sobic.001G314500 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10577: UBE2I, ubiquitin-conjugating enzyme E2 I
20 Sobic.001G463100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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