Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G283200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5W2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G150700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G270100 allantoinase, putative, expressed K01466: allantoinase
3 Sobic.003G338000 non-green plastid inner envelope membrane protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G145800 nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed -
5 Sobic.005G132200 expressed protein -
6 Sobic.002G031900 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed -
7 Sobic.001G368600 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G294400 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17499: PPM1G, protein phosphatase 1G
9 Sobic.004G271600 region found in RelA/SpoT proteins containing protein, expressed -
10 Sobic.003G058700 5-azacytidine resistance protein azr1, putative, expressed -
11 Sobic.003G190100 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
12 Sobic.008G006200 macrophage migration inhibitory factor, putative, expressed -
13 Sobic.004G111300 - -
14 Sobic.006G239000 "FLO2(Ortholog in rice:She et al., 2010)"(PubMedID : 31659901)@tetratricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed K03255: TIF31, protein TIF31
15 Sobic.010G057666 - -
16 Sobic.002G081400 ABC1 family domain containing protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
17 Sobic.002G198300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G378100 relA-SpoT like protein RSH1, putative, expressed -
19 Sobic.001G536700 expressed protein -
20 Sobic.003G073800 phosphatidate cytidylyltransferase, putative, expressed K00981: E2.7.7.41, CDS1, CDS2, phosphatidate cytidylyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic003G283200 Sobic003G283200 Sobic010G150700 Sobic010G150700 Sobic003G283200--Sobic010G150700 Sobic006G270100 Sobic006G270100 Sobic003G283200--Sobic006G270100 Sobic003G338000 Sobic003G338000 Sobic003G283200--Sobic003G338000 Sobic008G145800 Sobic008G145800 Sobic003G283200--Sobic008G145800 Sobic005G132200 Sobic005G132200 Sobic003G283200--Sobic005G132200 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic003G283200--Sobic002G031900 Sobic001G368600 Sobic001G368600 Sobic003G283200--Sobic001G368600 Sobic002G294400 Sobic002G294400 Sobic003G283200--Sobic002G294400 Sobic004G271600 Sobic004G271600 Sobic003G283200--Sobic004G271600 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic010G150700--Sobic002G244200 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic010G150700--Sobic003G160100 Sobic007G133000 Sobic007G133000 Sobic010G150700--Sobic007G133000 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic010G150700--Sobic005G095000 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic010G150700--Sobic004G086150 Sobic010G033100 Sobic010G033100 Sobic010G150700--Sobic010G033100 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic010G150700--Sobic005G068700 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic010G150700--Sobic009G248801 Sobic003G073800 Sobic003G073800 Sobic010G150700--Sobic003G073800 Sobic001G524000 Sobic001G524000 Sobic006G270100--Sobic001G524000 Sobic010G186100 Sobic010G186100 Sobic006G270100--Sobic010G186100 Sobic006G173800 Sobic006G173800 Sobic006G270100--Sobic006G173800 Sobic003G425600 Sobic003G425600 Sobic006G270100--Sobic003G425600 Sobic006G141300 Sobic006G141300 Sobic006G270100--Sobic006G141300 Sobic006G270100--Sobic003G283200 Sobic004G311400 Sobic004G311400 Sobic006G270100--Sobic004G311400 Sobic004G317300 Sobic004G317300 Sobic006G270100--Sobic004G317300 Sobic008G144900 Sobic008G144900 Sobic006G270100--Sobic008G144900 Sobic010G020800 Sobic010G020800 Sobic003G338000--Sobic010G020800 Sobic008G039100 Sobic008G039100 Sobic003G338000--Sobic008G039100 Sobic004G356700 Sobic004G356700 Sobic003G338000--Sobic004G356700 Sobic003G338000--Sobic006G173800 Sobic001G373900 Sobic001G373900 Sobic003G338000--Sobic001G373900 Sobic003G338000--Sobic004G317300 Sobic008G060000 Sobic008G060000 Sobic003G338000--Sobic008G060000 Sobic003G338000--Sobic008G144900 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic003G338000--Sobic001G519900 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic008G145800--Sobic001G456900 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic008G145800--Sobic007G159900 Sobic004G088200 Sobic004G088200 Sobic008G145800--Sobic004G088200 Sobic006G056700 Sobic006G056700 Sobic008G145800--Sobic006G056700 Sobic008G145800--Sobic004G311400 Sobic005G100700 Sobic005G100700 Sobic008G145800--Sobic005G100700 Sobic008G088200 Sobic008G088200 Sobic008G145800--Sobic008G088200 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic008G145800--Sobic004G129300 Sobic010G237900 Sobic010G237900 Sobic008G145800--Sobic010G237900 Sobic006G173600 Sobic006G173600 Sobic005G132200--Sobic006G173600 Sobic008G168300 Sobic008G168300 Sobic005G132200--Sobic008G168300 Sobic001G303200 Sobic001G303200 Sobic005G132200--Sobic001G303200 Sobic004G178100 Sobic004G178100 Sobic005G132200--Sobic004G178100 Sobic003G219200 Sobic003G219200 Sobic005G132200--Sobic003G219200 Sobic006G158100 Sobic006G158100 Sobic005G132200--Sobic006G158100 Sobic003G345500 Sobic003G345500 Sobic005G132200--Sobic003G345500 Sobic006G120500 Sobic006G120500 Sobic005G132200--Sobic006G120500 Sobic010G085100 Sobic010G085100 Sobic005G132200--Sobic010G085100 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic002G031900--Sobic005G145550 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic002G031900--Sobic004G324700 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic002G031900--Sobic007G163001 Sobic002G031900--Sobic010G186100 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic002G031900--Sobic008G111200 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic002G031900--Sobic001G475100 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic002G031900--Sobic003G207500 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic002G031900--Sobic008G021400 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic002G031900--Sobic010G214500 Sobic004G103300 Sobic004G103300 Sobic001G368600--Sobic004G103300 Sobic006G097500 Sobic006G097500 Sobic001G368600--Sobic006G097500 Sobic002G298800 Sobic002G298800 Sobic001G368600--Sobic002G298800 Sobic001G393300 Sobic001G393300 Sobic001G368600--Sobic001G393300 Sobic007G135800 Sobic007G135800 Sobic001G368600--Sobic007G135800 Sobic002G072500 Sobic002G072500 Sobic001G368600--Sobic002G072500 Sobic002G198300 Sobic002G198300 Sobic001G368600--Sobic002G198300 Sobic007G166300 Sobic007G166300 Sobic001G368600--Sobic007G166300 Sobic006G025500 Sobic006G025500 Sobic001G368600--Sobic006G025500 Sobic001G410000 Sobic001G410000 Sobic002G294400--Sobic001G410000 Sobic001G436400 Sobic001G436400 Sobic002G294400--Sobic001G436400 Sobic002G081400 Sobic002G081400 Sobic002G294400--Sobic002G081400 Sobic002G294400--Sobic004G271600 Sobic003G288800 Sobic003G288800 Sobic002G294400--Sobic003G288800 Sobic002G085100 Sobic002G085100 Sobic002G294400--Sobic002G085100 Sobic004G207400 Sobic004G207400 Sobic002G294400--Sobic004G207400 Sobic003G340600 Sobic003G340600 Sobic002G294400--Sobic003G340600 Sobic004G317700 Sobic004G317700 Sobic002G294400--Sobic004G317700 Sobic002G132400 Sobic002G132400 Sobic004G271600--Sobic002G132400 Sobic004G271600--Sobic002G081400 Sobic010G100900 Sobic010G100900 Sobic004G271600--Sobic010G100900 Sobic002G351200 Sobic002G351200 Sobic004G271600--Sobic002G351200 Sobic007G124500 Sobic007G124500 Sobic004G271600--Sobic007G124500 Sobic004G271600--Sobic002G072500 Sobic006G090100 Sobic006G090100 Sobic004G271600--Sobic006G090100 Sobic001G509200 Sobic001G509200 Sobic004G271600--Sobic001G509200 Sobic002G060800 Sobic002G060800 Sobic004G271600--Sobic002G060800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.