Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G375700.1
Synonym Sb03g041560
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5XRD4
Pfam -
Panther DB PTHR33728 PTHR33728:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09812 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g65630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039512 , Zm00025a026586 , Zm00025a043748
Brachypodium KQK10872 , KQK06132 , KQK06131 , PNT73296
Barley -
Wheat TraesCS3A02G388400 , TraesCS1D02G266900 , TraesCS1D02G266900 , TraesCS1A02G266700 , TraesCS3D02G381200 , TraesCS3B02G420400 , TraesCS3B02G420400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G375700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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4 Sobic.008G061401 - -
5 Sobic.004G028300 expressed protein -
6 Sobic.006G084400 OsAPx7 - Stromal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
7 Sobic.006G140500 photosystem-II repair protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G235350 - -
9 Sobic.007G133900 terpene synthase, putative, expressed -
10 Sobic.006G063900 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G194100 expressed protein -
12 Sobic.004G020300 expressed protein -
13 Sobic.005G200200 expressed protein -
14 Sobic.001G350000 expressed protein -
15 Sobic.001G076900 Uncharacterised protein family (UPF0497)(PubMedID : 26465154)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G047700 starch synthase, putative, expressed K00703: starch synthase
17 Sobic.005G202500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
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19 Sobic.005G134100 rubredoxin family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G033100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G375700 Sobic003G375700 Sobic008G064500 Sobic008G064500 Sobic003G375700--Sobic008G064500 Sobic009G210200 Sobic009G210200 Sobic003G375700--Sobic009G210200 Sobic003G370000 Sobic003G370000 Sobic003G375700--Sobic003G370000 Sobic008G061401 Sobic008G061401 Sobic003G375700--Sobic008G061401 Sobic004G028300 Sobic004G028300 Sobic003G375700--Sobic004G028300 Sobic006G084400 Sobic006G084400 Sobic003G375700--Sobic006G084400 Sobic006G140500 Sobic006G140500 Sobic003G375700--Sobic006G140500 Sobic006G235350 Sobic006G235350 Sobic003G375700--Sobic006G235350 Sobic007G133900 Sobic007G133900 Sobic003G375700--Sobic007G133900 Sobic008G064500--Sobic006G235350 Sobic008G064500--Sobic009G210200 Sobic008G064500--Sobic006G140500 Sobic008G064500--Sobic003G370000 Sobic002G314300 Sobic002G314300 Sobic008G064500--Sobic002G314300 Sobic001G289500 Sobic001G289500 Sobic008G064500--Sobic001G289500 Sobic003G005000 Sobic003G005000 Sobic008G064500--Sobic003G005000 Sobic004G303200 Sobic004G303200 Sobic008G064500--Sobic004G303200 Sobic002G047400 Sobic002G047400 Sobic008G064500--Sobic002G047400 Sobic009G210200--Sobic008G064500 Sobic009G210200--Sobic004G303200 Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic009G210200--Sobic004G020300 Sobic006G067400 Sobic006G067400 Sobic009G210200--Sobic006G067400 Sobic010G160700 Sobic010G160700 Sobic009G210200--Sobic010G160700 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic009G210200--Sobic008G171300 Sobic002G233700 Sobic002G233700 Sobic009G210200--Sobic002G233700 Sobic009G210200--Sobic006G235350 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic009G210200--Sobic002G272100 Sobic007G161500 Sobic007G161500 Sobic003G370000--Sobic007G161500 Sobic003G370000--Sobic001G289500 Sobic005G056400 Sobic005G056400 Sobic003G370000--Sobic005G056400 Sobic002G370600 Sobic002G370600 Sobic003G370000--Sobic002G370600 Sobic003G370000--Sobic002G314300 Sobic004G305800 Sobic004G305800 Sobic003G370000--Sobic004G305800 Sobic001G020100 Sobic001G020100 Sobic003G370000--Sobic001G020100 Sobic004G238600 Sobic004G238600 Sobic003G370000--Sobic004G238600 Sobic001G076900 Sobic001G076900 Sobic003G370000--Sobic001G076900 Sobic003G234400 Sobic003G234400 Sobic008G061401--Sobic003G234400 Sobic009G043000 Sobic009G043000 Sobic008G061401--Sobic009G043000 Sobic008G061401--Sobic006G067400 Sobic008G061401--Sobic003G370000 Sobic010G153900 Sobic010G153900 Sobic008G061401--Sobic010G153900 Sobic005G200200 Sobic005G200200 Sobic008G061401--Sobic005G200200 Sobic008G188600 Sobic008G188600 Sobic008G061401--Sobic008G188600 Sobic007G173800 Sobic007G173800 Sobic008G061401--Sobic007G173800 Sobic008G061401--Sobic001G076900 Sobic008G088821 Sobic008G088821 Sobic004G028300--Sobic008G088821 Sobic001G167900 Sobic001G167900 Sobic004G028300--Sobic001G167900 Sobic004G028300--Sobic006G140500 Sobic006G063900 Sobic006G063900 Sobic004G028300--Sobic006G063900 Sobic001G015200 Sobic001G015200 Sobic004G028300--Sobic001G015200 Sobic005G134100 Sobic005G134100 Sobic004G028300--Sobic005G134100 Sobic003G419900 Sobic003G419900 Sobic004G028300--Sobic003G419900 Sobic004G359600 Sobic004G359600 Sobic004G028300--Sobic004G359600 Sobic006G108200 Sobic006G108200 Sobic004G028300--Sobic006G108200 Sobic002G225400 Sobic002G225400 Sobic006G084400--Sobic002G225400 Sobic001G500100 Sobic001G500100 Sobic006G084400--Sobic001G500100 Sobic001G033100 Sobic001G033100 Sobic006G084400--Sobic001G033100 Sobic001G222600 Sobic001G222600 Sobic006G084400--Sobic001G222600 Sobic009G185201 Sobic009G185201 Sobic006G084400--Sobic009G185201 Sobic007G108800 Sobic007G108800 Sobic006G084400--Sobic007G108800 Sobic006G084400--Sobic009G210200 Sobic005G038400 Sobic005G038400 Sobic006G084400--Sobic005G038400 Sobic006G084400--Sobic003G375700 Sobic006G140500--Sobic008G088821 Sobic006G140500--Sobic006G235350 Sobic006G140500--Sobic001G015200 Sobic001G029600 Sobic001G029600 Sobic006G140500--Sobic001G029600 Sobic009G119300 Sobic009G119300 Sobic006G140500--Sobic009G119300 Sobic006G140500--Sobic004G028300 Sobic004G202200 Sobic004G202200 Sobic006G140500--Sobic004G202200 Sobic005G028800 Sobic005G028800 Sobic006G140500--Sobic005G028800 Sobic007G166300 Sobic007G166300 Sobic006G140500--Sobic007G166300 Sobic006G235350--Sobic006G140500 Sobic006G235350--Sobic004G202200 Sobic006G235350--Sobic007G166300 Sobic006G235350--Sobic005G028800 Sobic006G235350--Sobic003G005000 Sobic006G235350--Sobic001G289500 Sobic002G223700 Sobic002G223700 Sobic006G235350--Sobic002G223700 Sobic006G235350--Sobic001G015200 Sobic009G132000 Sobic009G132000 Sobic006G235350--Sobic009G132000 Sobic005G202500 Sobic005G202500 Sobic007G133900--Sobic005G202500 Sobic007G133900--Sobic008G061401 Sobic007G133900--Sobic001G076900 Sobic004G251500 Sobic004G251500 Sobic007G133900--Sobic004G251500 Sobic010G047700 Sobic010G047700 Sobic007G133900--Sobic010G047700 Sobic005G004500 Sobic005G004500 Sobic007G133900--Sobic005G004500 Sobic007G133900--Sobic001G033100 Sobic007G133900--Sobic007G173800 Sobic005G194100 Sobic005G194100 Sobic007G133900--Sobic005G194100
Octagon: transcription factors


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