Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G390100.5
Synonym Sb03g042770
Functional annotation methyltransferase, putative, expressed
UniProt A0A1W0W0Z2
Pfam PF03141
Panther DB PTHR10108 PTHR10108:SF929
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008168; methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G43200 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g67360.1 : methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026418
Brachypodium KQK11030 , KQK11031
Barley HORVU3Hr1G089210.11 , HORVU3Hr1G089210.10 , HORVU3Hr1G089210.9 , HORVU3Hr1G089210.8 , HORVU3Hr1G089210.7 , HORVU3Hr1G089210.6 , HORVU3Hr1G089210.5 , HORVU3Hr1G089210.4 , HORVU3Hr1G089210.3 , HORVU3Hr1G089210.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G146700 transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed K15015: SLC32A, solute carrier family 32 (vesicular inhibitory amino acid transporter)
2 Sobic.008G114600 - -
3 Sobic.006G263700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
5 Sobic.010G074700 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed -
6 Sobic.005G110544 - -
7 Sobic.002G181450 - -
8 Sobic.003G420201 - -
9 Sobic.003G042100 MAR-binding filament-like protein 1, putative, expressed -
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12 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
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14 Sobic.004G044100 expressed protein -
15 Sobic.006G111300 expressed protein -
16 Sobic.005G001900 - -
17 Sobic.006G139300 plant protein of unknown function DUF869 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G169501 - -
20 Sobic.002G150766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G390100 Sobic003G390100 Sobic010G146700 Sobic010G146700 Sobic003G390100--Sobic010G146700 Sobic008G114600 Sobic008G114600 Sobic003G390100--Sobic008G114600 Sobic006G263700 Sobic006G263700 Sobic003G390100--Sobic006G263700 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic003G390100--Sobic003G315332 Sobic010G074700 Sobic010G074700 Sobic003G390100--Sobic010G074700 Sobic005G110544 Sobic005G110544 Sobic003G390100--Sobic005G110544 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic003G390100--Sobic002G181450 Sobic003G420201 Sobic003G420201 Sobic003G390100--Sobic003G420201 Sobic003G042100 Sobic003G042100 Sobic003G390100--Sobic003G042100 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic010G146700--Sobic001G479500 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic010G146700--Sobic001G046600 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic010G146700--Sobic004G016500 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic010G146700--Sobic005G130200 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic010G146700--Sobic004G212800 Sobic008G167300 Sobic008G167300 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Octagon: transcription factors


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