Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G033300.2,Sobic.004G033300.1
Synonym Sb04g002880
Functional annotation DNA polymerase V, putative, expressed
UniProt C5XTX8 , A0A1Z5RKQ0
Pfam PF04931
Panther DB PTHR13213 PTHR13213:SF2
NCBI CDD KOG1926; Predicted regulator of rRNA gene transcription (MYB-binding protein)
KEGG Orthology K02331; POL5, DNA polymerase phi
Gene Ontology GO:0006351; transcription, DNA-templated GO:0003887DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64420 : DNA polymerase V family
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g04270.1 : DNA polymerase V, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018906
Brachypodium KQJ93197
Barley HORVU6Hr1G018330.5 , HORVU6Hr1G018330.4 , HORVU6Hr1G018330.3 , HORVU6Hr1G018330.2 , HORVU6Hr1G018330.1
Wheat TraesCS6A02G101600 , TraesCS6B02G129600 , TraesCS6D02G089900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G033300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G033300 Sobic004G033300 Sobic008G178500 Sobic008G178500 Sobic004G033300--Sobic008G178500 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic004G033300--Sobic005G110523 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic004G033300--Sobic003G258900 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic004G033300--Sobic007G129401 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic004G033300--Sobic009G004700 Sobic007G031800 Sobic007G031800 Sobic004G033300--Sobic007G031800 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic004G033300--Sobic005G173366 Sobic008G150200 Sobic008G150200 Sobic004G033300--Sobic008G150200 Sobic002G331000 Sobic002G331000 Sobic004G033300--Sobic002G331000 Sobic008G178500--Sobic004G033300 Sobic008G178500--Sobic002G331000 Sobic010G270300 Sobic010G270300 Sobic008G178500--Sobic010G270300 Sobic008G178500--Sobic007G129401 Sobic005G005000 Sobic005G005000 Sobic008G178500--Sobic005G005000 Sobic002G213800 Sobic002G213800 Sobic008G178500--Sobic002G213800 Sobic004G345900 Sobic004G345900 Sobic008G178500--Sobic004G345900 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic008G178500--Sobic009G085400 Sobic008G178500--Sobic005G110523 Sobic005G110523--Sobic009G004700 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110523--Sobic006G009400 Sobic005G110523--Sobic005G005000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic005G110523--Sobic001G477800 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G110523--Sobic001G464200 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic005G110523--Sobic007G059300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic005G110523--Sobic004G169501 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic005G110523--Sobic003G089650 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic005G110523--Sobic009G113600 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic003G258900--Sobic002G396000 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic003G258900--Sobic002G158700 Sobic003G267800 Sobic003G267800 Sobic003G258900--Sobic003G267800 Sobic006G102100 Sobic006G102100 Sobic003G258900--Sobic006G102100 Sobic001G081000 Sobic001G081000 Sobic003G258900--Sobic001G081000 Sobic006G226300 Sobic006G226300 Sobic003G258900--Sobic006G226300 Sobic003G442000 Sobic003G442000 Sobic003G258900--Sobic003G442000 Sobic009G225200 Sobic009G225200 Sobic003G258900--Sobic009G225200 Sobic009G046700 Sobic009G046700 Sobic003G258900--Sobic009G046700 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic007G129401--Sobic009G026400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic007G129401--Sobic002G060500 Sobic007G129401--Sobic005G173366 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic007G129401--Sobic004G196500 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic007G129401--Sobic008G013900 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic007G129401--Sobic005G043400 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic007G129401--Sobic001G164200 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic007G129401--Sobic010G068200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic007G129401--Sobic009G101600 Sobic009G004700--Sobic009G113600 Sobic009G004700--Sobic003G089650 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G004700--Sobic002G062300 Sobic009G004700--Sobic005G110523 Sobic009G004700--Sobic007G059300 Sobic009G004700--Sobic009G026400 Sobic009G004700--Sobic006G009400 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic009G004700--Sobic005G212500 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G004700--Sobic003G031750 Sobic009G117300 Sobic009G117300 Sobic007G031800--Sobic009G117300 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic007G031800--Sobic009G117400 Sobic007G071950 Sobic007G071950 Sobic007G031800--Sobic007G071950 Sobic001G498200 Sobic001G498200 Sobic007G031800--Sobic001G498200 Sobic007G031800--Sobic009G225200 Sobic007G031800--Sobic005G173366 Sobic007G031800--Sobic003G258900 Sobic007G031800--Sobic007G129401 Sobic007G031800--Sobic001G464200 Sobic005G173366--Sobic007G129401 Sobic005G173366--Sobic009G026400 Sobic005G173366--Sobic002G060500 Sobic005G173366--Sobic005G043400 Sobic005G173366--Sobic004G196500 Sobic005G173366--Sobic009G101600 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic005G173366--Sobic003G416100 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G173366--SobicK010000 Sobic005G173366--Sobic007G059300 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G150200--Sobic001G305400 Sobic008G150200--Sobic002G060500 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic008G150200--Sobic002G221200 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic008G150200--Sobic001G261480 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic008G150200--Sobic004G200866 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G150200--Sobic001G240400 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic008G150200--Sobic005G142200 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G150200--Sobic004G121000 Sobic008G150200--Sobic009G101600 Sobic002G331000--Sobic004G345900 Sobic002G331000--Sobic002G213800 Sobic005G085200 Sobic005G085200 Sobic002G331000--Sobic005G085200 Sobic010G057400 Sobic010G057400 Sobic002G331000--Sobic010G057400 Sobic003G406700 Sobic003G406700 Sobic002G331000--Sobic003G406700 Sobic009G197000 Sobic009G197000 Sobic002G331000--Sobic009G197000 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic002G331000--Sobic004G199600 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic002G331000--Sobic009G078500 Sobic002G331000--Sobic010G270300
Octagon: transcription factors


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