Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G277300.1
Synonym Sb04g031430, ATL4, TL4
Functional annotation RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed
UniProt A0A194YS34
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF129
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10663; E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G60220 : TOXICOS EN LEVADURA 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g46340.1 : RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010027 , Zm00025a021574
Brachypodium KQJ84264 , KQK00823
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G508700 expressed protein -
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20 Sobic.001G278400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G277300 Sobic004G277300 Sobic001G508700 Sobic001G508700 Sobic004G277300--Sobic001G508700 Sobic002G256601 Sobic002G256601 Sobic004G277300--Sobic002G256601 Sobic001G484500 Sobic001G484500 Sobic004G277300--Sobic001G484500 Sobic006G165650 Sobic006G165650 Sobic004G277300--Sobic006G165650 Sobic001G280300 Sobic001G280300 Sobic004G277300--Sobic001G280300 Sobic003G018400 Sobic003G018400 Sobic004G277300--Sobic003G018400 Sobic002G041900 Sobic002G041900 Sobic004G277300--Sobic002G041900 Sobic005G060400 Sobic005G060400 Sobic004G277300--Sobic005G060400 Sobic002G248600 Sobic002G248600 Sobic004G277300--Sobic002G248600 Sobic002G060750 Sobic002G060750 Sobic001G508700--Sobic002G060750 Sobic001G275400 Sobic001G275400 Sobic001G508700--Sobic001G275400 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic001G508700--Sobic002G246950 Sobic002G264700 Sobic002G264700 Sobic001G508700--Sobic002G264700 Sobic003G398900 Sobic003G398900 Sobic001G508700--Sobic003G398900 Sobic001G508700--Sobic003G018400 Sobic001G428900 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Octagon: transcription factors


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