Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G298700.1
Synonym Sb04g033270
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
-
UniProt C5XS19
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020918
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G181600 dehydrogenase, putative, expressed K00008: SORD, L-iditol 2-dehydrogenase
2 Sobic.001G011800 SAM domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G245000 - -
4 Sobic.002G271600 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
5 Sobic.006G180900 ZOS4-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.008G051400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G127300 pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G129000 - -
9 Sobic.005G089000 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
10 Sobic.007G090442 - -
11 Sobic.007G224300 RING finger protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G137400 cysteine-rich receptor-like protein kinase 10 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.010G079800 expressed protein -
14 Sobic.001G310500 strictosidine synthase, putative, expressed -
15 Sobic.007G139900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.010G079700 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 4, putative, expressed -
17 Sobic.002G400400 choline transporter-related, putative, expressed -
18 Sobic.003G111400 - -
19 Sobic.003G151800 expressed protein -
20 Sobic.004G247400 caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase


Gene co-expression network
sample Sobic004G298700 Sobic004G298700 Sobic007G181600 Sobic007G181600 Sobic004G298700--Sobic007G181600 Sobic001G011800 Sobic001G011800 Sobic004G298700--Sobic001G011800 Sobic006G245000 Sobic006G245000 Sobic004G298700--Sobic006G245000 Sobic002G271600 Sobic002G271600 Sobic004G298700--Sobic002G271600 Sobic006G180900 Sobic006G180900 Sobic004G298700--Sobic006G180900 Sobic008G051400 Sobic008G051400 Sobic004G298700--Sobic008G051400 Sobic009G127300 Sobic009G127300 Sobic004G298700--Sobic009G127300 Sobic005G129000 Sobic005G129000 Sobic004G298700--Sobic005G129000 Sobic005G089000 Sobic005G089000 Sobic004G298700--Sobic005G089000 Sobic007G181600--Sobic004G298700 Sobic007G090442 Sobic007G090442 Sobic007G181600--Sobic007G090442 Sobic007G181600--Sobic006G180900 Sobic001G310500 Sobic001G310500 Sobic007G181600--Sobic001G310500 Sobic008G013000 Sobic008G013000 Sobic007G181600--Sobic008G013000 Sobic010G095300 Sobic010G095300 Sobic007G181600--Sobic010G095300 Sobic003G111400 Sobic003G111400 Sobic007G181600--Sobic003G111400 Sobic001G037800 Sobic001G037800 Sobic007G181600--Sobic001G037800 Sobic007G181600--Sobic001G011800 Sobic001G011800--Sobic009G127300 Sobic001G011800--Sobic007G181600 Sobic007G050300 Sobic007G050300 Sobic001G011800--Sobic007G050300 Sobic001G011800--Sobic004G298700 Sobic010G079800 Sobic010G079800 Sobic001G011800--Sobic010G079800 Sobic006G094500 Sobic006G094500 Sobic001G011800--Sobic006G094500 Sobic002G400400 Sobic002G400400 Sobic001G011800--Sobic002G400400 Sobic006G276200 Sobic006G276200 Sobic001G011800--Sobic006G276200 Sobic003G436500 Sobic003G436500 Sobic001G011800--Sobic003G436500 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic006G245000--Sobic002G066901 Sobic006G245000--Sobic007G181600 Sobic006G245000--Sobic004G298700 Sobic006G245000--Sobic006G180900 Sobic006G245000--Sobic008G051400 Sobic006G245000--Sobic010G079800 Sobic006G245000--Sobic001G310500 Sobic007G140500 Sobic007G140500 Sobic006G245000--Sobic007G140500 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic006G245000--Sobic001G267000 Sobic007G014600 Sobic007G014600 Sobic002G271600--Sobic007G014600 Sobic002G209100 Sobic002G209100 Sobic002G271600--Sobic002G209100 Sobic002G041800 Sobic002G041800 Sobic002G271600--Sobic002G041800 Sobic004G217700 Sobic004G217700 Sobic002G271600--Sobic004G217700 Sobic001G145050 Sobic001G145050 Sobic002G271600--Sobic001G145050 Sobic009G205600 Sobic009G205600 Sobic002G271600--Sobic009G205600 Sobic006G053700 Sobic006G053700 Sobic002G271600--Sobic006G053700 Sobic004G195800 Sobic004G195800 Sobic002G271600--Sobic004G195800 Sobic002G366100 Sobic002G366100 Sobic002G271600--Sobic002G366100 Sobic004G285400 Sobic004G285400 Sobic006G180900--Sobic004G285400 Sobic006G180900--Sobic007G181600 Sobic006G180900--Sobic001G310500 Sobic006G180900--Sobic008G013000 Sobic006G180900--Sobic006G245000 Sobic002G282900 Sobic002G282900 Sobic006G180900--Sobic002G282900 Sobic007G170400 Sobic007G170400 Sobic006G180900--Sobic007G170400 Sobic006G180900--Sobic005G129000 Sobic004G158300 Sobic004G158300 Sobic006G180900--Sobic004G158300 Sobic007G224300 Sobic007G224300 Sobic008G051400--Sobic007G224300 Sobic008G051400--Sobic006G094500 Sobic006G099800 Sobic006G099800 Sobic008G051400--Sobic006G099800 Sobic008G051400--Sobic007G181600 Sobic008G051400--Sobic001G011800 Sobic004G028800 Sobic004G028800 Sobic008G051400--Sobic004G028800 Sobic001G148700 Sobic001G148700 Sobic008G051400--Sobic001G148700 Sobic004G015400 Sobic004G015400 Sobic008G051400--Sobic004G015400 Sobic009G149800 Sobic009G149800 Sobic008G051400--Sobic009G149800 Sobic009G127300--Sobic001G011800 Sobic009G127300--Sobic003G436500 Sobic004G023900 Sobic004G023900 Sobic009G127300--Sobic004G023900 Sobic009G127300--Sobic006G276200 Sobic001G147100 Sobic001G147100 Sobic009G127300--Sobic001G147100 Sobic004G028000 Sobic004G028000 Sobic009G127300--Sobic004G028000 Sobic001G218800 Sobic001G218800 Sobic009G127300--Sobic001G218800 Sobic002G037800 Sobic002G037800 Sobic009G127300--Sobic002G037800 Sobic001G012100 Sobic001G012100 Sobic009G127300--Sobic001G012100 Sobic005G129000--Sobic001G310500 Sobic001G125700 Sobic001G125700 Sobic005G129000--Sobic001G125700 Sobic006G005500 Sobic006G005500 Sobic005G129000--Sobic006G005500 Sobic006G005400 Sobic006G005400 Sobic005G129000--Sobic006G005400 Sobic007G076000 Sobic007G076000 Sobic005G129000--Sobic007G076000 Sobic005G219100 Sobic005G219100 Sobic005G129000--Sobic005G219100 Sobic007G055600 Sobic007G055600 Sobic005G129000--Sobic007G055600 Sobic009G014600 Sobic009G014600 Sobic005G129000--Sobic009G014600 Sobic005G219000 Sobic005G219000 Sobic005G129000--Sobic005G219000 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic005G089000--Sobic002G195700 Sobic001G321600 Sobic001G321600 Sobic005G089000--Sobic001G321600 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic005G089000--Sobic008G073400 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic005G089000--Sobic001G019300 Sobic001G005500 Sobic001G005500 Sobic005G089000--Sobic001G005500 Sobic003G135800 Sobic003G135800 Sobic005G089000--Sobic003G135800 Sobic003G291400 Sobic003G291400 Sobic005G089000--Sobic003G291400 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic005G089000--Sobic003G106500 Sobic001G452700 Sobic001G452700 Sobic005G089000--Sobic001G452700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.