Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G339600.1
Synonym Sb04g036710
Functional annotation ankyrin repeat domain containing protein, expressed
UniProt C5XV80
Pfam PF11904
Panther DB PTHR12447 PTHR12447:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G04470 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g56530.1 : ankyrin repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022551 , Zm00025a048204 , Zm00025a032837
Brachypodium KQK01283
Barley HORVU6Hr1G089010.4 , HORVU6Hr1G089010.5 , HORVU6Hr1G089010.1 , HORVU6Hr1G089010.2 , HORVU6Hr1G089010.3
Wheat TraesCS6B02G417700 , TraesCS6A02G379500 , TraesCS6D02G363800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G339600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G153400 methyl-CpG binding domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G165700 expressed protein -
3 Sobic.006G171700 - -
4 Sobic.003G368800 expressed protein -
5 Sobic.009G029500 cation efflux family protein, putative, expressed K14689: SLC30A2, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2
6 Sobic.001G136600 serine/threonine protein phosphatase 2A 59 kDa regulatory subunit Bgamma isoform, putative, expressed K11584: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'
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8 Sobic.004G227300 vacuolar protein-sorting protein bro1, putative, expressed K12200: PDCD6IP, ALIX, programmed cell death 6-interacting protein
9 Sobic.002G259400 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
10 Sobic.003G174800 - -
11 Sobic.005G196950 - -
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13 Sobic.005G033300 microfibrillar-associated protein 1, putative, expressed K13110: microfibrillar-associated protein 1
14 Sobic.008G000900 - -
15 Sobic.006G087400 expressed protein -
16 Sobic.005G084400 la domain containing protein, expressed K15191: La-related protein 7
17 Sobic.005G155800 actin polymerization factor, putative, expressed K05754: actin related protein 2/3 complex, subunit 5
18 Sobic.002G353700 ZOS7-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.010G143200 - -
20 Sobic.003G000150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G339600 Sobic004G339600 Sobic001G153400 Sobic001G153400 Sobic004G339600--Sobic001G153400 Sobic008G165700 Sobic008G165700 Sobic004G339600--Sobic008G165700 Sobic006G171700 Sobic006G171700 Sobic004G339600--Sobic006G171700 Sobic003G368800 Sobic003G368800 Sobic004G339600--Sobic003G368800 Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic004G339600--Sobic009G029500 Sobic001G136600 Sobic001G136600 Sobic004G339600--Sobic001G136600 Sobic009G209200 Sobic009G209200 Sobic004G339600--Sobic009G209200 Sobic004G227300 Sobic004G227300 Sobic004G339600--Sobic004G227300 Sobic002G259400 Sobic002G259400 Sobic004G339600--Sobic002G259400 Sobic002G317300 Sobic002G317300 Sobic001G153400--Sobic002G317300 Sobic004G301900 Sobic004G301900 Sobic001G153400--Sobic004G301900 Sobic006G270900 Sobic006G270900 Sobic001G153400--Sobic006G270900 Sobic003G010400 Sobic003G010400 Sobic001G153400--Sobic003G010400 Sobic009G238850 Sobic009G238850 Sobic001G153400--Sobic009G238850 Sobic002G113900 Sobic002G113900 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Octagon: transcription factors


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