Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G032100.1
Synonym
Functional annotation hypothetical protein
UniProt A0A1B6PPX2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20230.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G231350 - -
2 Sobic.003G276750 - -
3 Sobic.001G180600 OsMADS87 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
4 Sobic.004G150700 - -
5 Sobic.010G212350 - -
6 Sobic.005G221000 hypothetical protein -
7 Sobic.002G210800 hypothetical protein -
8 Sobic.009G120200 expressed protein -
9 Sobic.003G315500 adhesive/proline-rich protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G042100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.006G006300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.007G034000 expressed protein -
13 Sobic.006G082000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSub41 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
14 Sobic.006G112200 - -
15 Sobic.007G016500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.003G241050 - -
17 Sobic.001G233300 - -
18 Sobic.010G119700 - -
19 Sobic.002G143766 - -
20 Sobic.002G077700 O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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