Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G061801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHV4
Pfam PF00102
Panther DB PTHR19134 PTHR19134:SF317
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006470; protein dephosphorylation GO:0004725protein tyrosine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71860 : protein tyrosine phosphatase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07590.1 : Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012797 , Zm00025a025719
Brachypodium PNT64063
Barley -
Wheat TraesCS4D02G092700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G309900 cupin 2, conserved barrel domain protein, putative, expressed K14977: ylbA, (S)-ureidoglycine aminohydrolase
2 Sobic.001G355800 methyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.008G070800 expressed protein -
4 Sobic.006G092000 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
5 Sobic.006G091900 expressed protein K05894: 12-oxophytodienoic acid reductase
6 Sobic.002G383800 GTP-binding protein, putative, expressed K06944: uncharacterized protein
7 Sobic.003G404300 expressed protein K11368: ENY2, DC6, enhancer of yellow 2 transcription factor
8 Sobic.005G100600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G063100 Mitochondrial substrate carrier family protein(PubMedID : 26465154)@mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G188600 stromal membrane-associated protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
11 Sobic.001G085600 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G262200 E3 ubiquitin ligase, putative, expressed K16276: K16276, zinc finger protein-like protein
13 Sobic.008G088806 - K16280: E3 ubiquitin-protein ligase RGLG
14 Sobic.006G271500 phosphomannomutase, putative, expressed K17497: phosphomannomutase
15 Sobic.002G131200 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G173600 serine racemase, putative, expressed K12235: serine racemase
17 Sobic.010G186000 expressed protein -
18 Sobic.003G306300 amino acid kinase, putative, expressed -
19 Sobic.008G088809 - -
20 Sobic.002G091600 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G061801 Sobic005G061801 Sobic002G309900 Sobic002G309900 Sobic005G061801--Sobic002G309900 Sobic001G355800 Sobic001G355800 Sobic005G061801--Sobic001G355800 Sobic008G070800 Sobic008G070800 Sobic005G061801--Sobic008G070800 Sobic006G092000 Sobic006G092000 Sobic005G061801--Sobic006G092000 Sobic006G091900 Sobic006G091900 Sobic005G061801--Sobic006G091900 Sobic002G383800 Sobic002G383800 Sobic005G061801--Sobic002G383800 Sobic003G404300 Sobic003G404300 Sobic005G061801--Sobic003G404300 Sobic005G100600 Sobic005G100600 Sobic005G061801--Sobic005G100600 Sobic009G063100 Sobic009G063100 Sobic005G061801--Sobic009G063100 Sobic002G091600 Sobic002G091600 Sobic002G309900--Sobic002G091600 Sobic002G131200 Sobic002G131200 Sobic002G309900--Sobic002G131200 Sobic002G309900--Sobic008G070800 Sobic001G085600 Sobic001G085600 Sobic002G309900--Sobic001G085600 Sobic001G303100 Sobic001G303100 Sobic002G309900--Sobic001G303100 Sobic002G309900--Sobic006G092000 Sobic002G309900--Sobic005G100600 Sobic002G111200 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Octagon: transcription factors


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