Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G124350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIR1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G08947 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g28510.4 : importin subunit beta, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043478 , Zm00025a037666
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G181450 - -
2 Sobic.005G001900 - -
3 Sobic.002G124200 expressed protein -
4 Sobic.003G204000 expressed protein -
5 Sobic.010G153466 - -
6 Sobic.002G182300 - -
7 Sobic.003G136800 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K15053: charged multivesicular body protein 7
8 Sobic.001G172200 - -
9 Sobic.003G201750 - -
10 Sobic.002G039600 - -
11 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
12 Sobic.001G428000 uncharacterized TPR repeat-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G076400 structural constituent of ribosome, putative, expressed -
14 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
15 Sobic.004G169501 - -
16 Sobic.007G142050 - -
17 Sobic.002G346600 transporter family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G186000 CD2-binding protein-related, putative, expressed K13099: CD2BP2, CD2 antigen cytoplasmic tail-binding protein 2
19 Sobic.005G099150 - -
20 Sobic.007G225800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K15335: NSUN2, tRNA (cytosine34-C5)-methyltransferase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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