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Transcriptome id Sobic.006G071814.1
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UniProt A0A1B6PKQ6
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.006G011000 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12893: splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
2 Sobic.001G249700 expressed protein K11877: PSMG3, proteasome assembly chaperone 3
3 Sobic.001G218800 expressed protein -
4 Sobic.001G147100 pre-rRNA-processing protein TSR2, putative, expressed K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
5 Sobic.006G183000 RING zinc finger protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G016300 PPR repeat containing protein, expressed -
7 Sobic.009G201800 MPPN domain containing protein, expressed K14313: NUP35, nuclear pore complex protein Nup53
8 Sobic.008G080000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G207500 expressed protein -
10 Sobic.008G115600 RNA polymerase Rpb7, N-terminal domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G260400 expressed protein K07018: uncharacterized protein
12 Sobic.010G267500 bZIP orthologous(PubMedID : 28671251)@E2F-related protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G057800 URED, putative, expressed K03190: ureD, urease accessory protein
14 Sobic.009G033900 snurportin-1, putative, expressed K13151: SNUPN, snurportin-1
15 Sobic.009G001100 expressed protein -
16 Sobic.005G056600 CAMK_CAMK_like.43 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
17 Sobic.001G527300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
18 Sobic.009G150700 expressed protein -
19 Sobic.009G195300 DUF803 domain containing, putative, expressed -
20 Sobic.006G233300 RNA binding protein, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3


Gene co-expression network
sample Sobic006G071814 Sobic006G071814 Sobic006G011000 Sobic006G011000 Sobic006G071814--Sobic006G011000 Sobic001G249700 Sobic001G249700 Sobic006G071814--Sobic001G249700 Sobic001G218800 Sobic001G218800 Sobic006G071814--Sobic001G218800 Sobic001G147100 Sobic001G147100 Sobic006G071814--Sobic001G147100 Sobic006G183000 Sobic006G183000 Sobic006G071814--Sobic006G183000 Sobic004G016300 Sobic004G016300 Sobic006G071814--Sobic004G016300 Sobic009G201800 Sobic009G201800 Sobic006G071814--Sobic009G201800 Sobic008G080000 Sobic008G080000 Sobic006G071814--Sobic008G080000 Sobic006G207500 Sobic006G207500 Sobic006G071814--Sobic006G207500 Sobic006G094600 Sobic006G094600 Sobic006G011000--Sobic006G094600 Sobic001G329300 Sobic001G329300 Sobic006G011000--Sobic001G329300 Sobic002G204000 Sobic002G204000 Sobic006G011000--Sobic002G204000 Sobic008G137600 Sobic008G137600 Sobic006G011000--Sobic008G137600 Sobic006G011000--Sobic001G147100 Sobic006G109700 Sobic006G109700 Sobic006G011000--Sobic006G109700 Sobic001G532100 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Octagon: transcription factors


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