Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G196600.1
Synonym Sb06g026890
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PMY6
Pfam -
Panther DB PTHR36368 PTHR36368:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g14390.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056716
Brachypodium KQJ84287 , PNT61734
Barley HORVU2Hr1G105700.1
Wheat TraesCS2A02G450200 , TraesCS2A02G450100 , TraesCS2D02G449600 , TraesCS2D02G449700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G051000 POLA3 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed K02685: DNA primase large subunit
2 Sobic.003G183700 MCM4 - Putative minichromosome maintenance MCM complex subunit 4, expressed K02212: MCM4, DNA replication licensing factor MCM4
3 Sobic.006G195500 DNA-binding protein, putative, expressed K10742: DNA replication ATP-dependent helicase Dna2
4 Sobic.004G317000 growth regulating factor protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G377700 expressed protein K10895: fanconi anemia group I protein
6 Sobic.007G187700 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
7 Sobic.006G275500 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -
8 Sobic.005G157300 protein binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G103700 POLA2 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed K02321: DNA polymerase alpha subunit B
10 Sobic.003G032200 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G087000 MCM6 - Putative minichromosome maintenance MCM complex subunit 6, expressed K02542: DNA replication licensing factor MCM6
12 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
13 Sobic.002G168000 expressed protein -
14 Sobic.002G223900 OsFBX330 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G179500 expressed protein K06676: BRRN1, BRN1, condensin complex subunit 2
16 Sobic.010G147700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11274: WDHD1, chromosome transmission fidelity protein 4
17 Sobic.009G101100 patellin protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G230800 expressed protein -
19 Sobic.009G146250 - -
20 Sobic.002G286700 lysM domain-containing GPI-anchored protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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