Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G244300.1
Synonym GC2
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PNP3
Pfam -
Panther DB PTHR13815 PTHR13815:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18190 : golgin candidate 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046865 , Zm00025a058044 , Zm00025a058022 , Zm00025a031756 , Zm00025a009499 , Zm00025a008174 , Zm00025a029841 , Zm00025a034501 , Zm00025a058045 , Zm00025a007098 , Zm00025a003750
Brachypodium KQJ84994
Barley HORVU2Hr1G113000.3 , HORVU2Hr1G113000.2 , HORVU2Hr1G113000.1 , HORVU2Hr1G112890.2 , HORVU2Hr1G112890.1 , HORVU2Hr1G112890.7 , HORVU2Hr1G112890.6 , HORVU2Hr1G112890.5 , HORVU2Hr1G112890.4
Wheat TraesCS2B02G536000 , TraesCS2D02G508600 , TraesCS2A02G507900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G244300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G408700 kinesin like protein, putative, expressed K18182: cytochrome c oxidase assembly protein subunit 16
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18 Sobic.006G202200 ENTH domain containing protein, expressed K12471: epsin
19 Sobic.004G246100 nicalin, putative, expressed K06171: nicastrin
20 Sobic.003G073000 IWS1 C-terminus family protein, putative, expressed K17498: SPN1, transcription factor SPN1


Gene co-expression network
sample Sobic006G244300 Sobic006G244300 Sobic001G408700 Sobic001G408700 Sobic006G244300--Sobic001G408700 Sobic004G015800 Sobic004G015800 Sobic006G244300--Sobic004G015800 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic006G244300--Sobic006G046700 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic006G244300--Sobic004G345400 Sobic003G205501 Sobic003G205501 Sobic006G244300--Sobic003G205501 Sobic010G074900 Sobic010G074900 Sobic006G244300--Sobic010G074900 Sobic008G058800 Sobic008G058800 Sobic006G244300--Sobic008G058800 Sobic004G345700 Sobic004G345700 Sobic006G244300--Sobic004G345700 Sobic009G129600 Sobic009G129600 Sobic006G244300--Sobic009G129600 Sobic001G408700--Sobic003G205501 Sobic004G007300 Sobic004G007300 Sobic001G408700--Sobic004G007300 Sobic001G408700--Sobic004G345700 Sobic001G056200 Sobic001G056200 Sobic001G408700--Sobic001G056200 Sobic007G118200 Sobic007G118200 Sobic001G408700--Sobic007G118200 Sobic006G267300 Sobic006G267300 Sobic001G408700--Sobic006G267300 Sobic002G197100 Sobic002G197100 Sobic001G408700--Sobic002G197100 Sobic004G283000 Sobic004G283000 Sobic001G408700--Sobic004G283000 Sobic010G245000 Sobic010G245000 Sobic001G408700--Sobic010G245000 Sobic001G235000 Sobic001G235000 Sobic004G015800--Sobic001G235000 Sobic004G015800--Sobic001G408700 Sobic004G015800--Sobic004G007300 Sobic006G128800 Sobic006G128800 Sobic004G015800--Sobic006G128800 Sobic004G015800--Sobic004G345700 Sobic006G092800 Sobic006G092800 Sobic004G015800--Sobic006G092800 Sobic001G514000 Sobic001G514000 Sobic004G015800--Sobic001G514000 Sobic010G174800 Sobic010G174800 Sobic004G015800--Sobic010G174800 Sobic004G015800--Sobic006G244300 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic006G046700--Sobic008G153000 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G046700--Sobic004G031700 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic006G046700--Sobic007G026000 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G046700--Sobic001G206100 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic006G046700--Sobic001G306900 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic006G046700--Sobic003G445400 Sobic001G425000 Sobic001G425000 Sobic006G046700--Sobic001G425000 Sobic001G405300 Sobic001G405300 Sobic006G046700--Sobic001G405300 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G046700--Sobic006G013500 Sobic001G042200 Sobic001G042200 Sobic004G345400--Sobic001G042200 Sobic010G077500 Sobic010G077500 Sobic004G345400--Sobic010G077500 Sobic009G249700 Sobic009G249700 Sobic004G345400--Sobic009G249700 Sobic007G042900 Sobic007G042900 Sobic004G345400--Sobic007G042900 Sobic004G180900 Sobic004G180900 Sobic004G345400--Sobic004G180900 Sobic006G186400 Sobic006G186400 Sobic004G345400--Sobic006G186400 Sobic004G084500 Sobic004G084500 Sobic004G345400--Sobic004G084500 Sobic007G056500 Sobic007G056500 Sobic004G345400--Sobic007G056500 Sobic003G394200 Sobic003G394200 Sobic004G345400--Sobic003G394200 Sobic003G205501--Sobic001G408700 Sobic003G205501--Sobic006G128800 Sobic003G205501--Sobic004G345700 Sobic003G205501--Sobic006G267300 Sobic010G202600 Sobic010G202600 Sobic003G205501--Sobic010G202600 Sobic003G205501--Sobic010G245000 Sobic008G127400 Sobic008G127400 Sobic003G205501--Sobic008G127400 Sobic003G205501--Sobic008G058800 Sobic003G248500 Sobic003G248500 Sobic003G205501--Sobic003G248500 Sobic010G074900--Sobic004G345700 Sobic010G074900--Sobic003G205501 Sobic010G074900--Sobic001G408700 Sobic001G193100 Sobic001G193100 Sobic010G074900--Sobic001G193100 Sobic010G074900--Sobic004G084500 Sobic006G091000 Sobic006G091000 Sobic010G074900--Sobic006G091000 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic010G074900--Sobic005G040900 Sobic010G074900--Sobic004G007300 Sobic003G398400 Sobic003G398400 Sobic010G074900--Sobic003G398400 Sobic008G058800--Sobic001G042200 Sobic008G058800--Sobic009G129600 Sobic006G248500 Sobic006G248500 Sobic008G058800--Sobic006G248500 Sobic008G058800--Sobic003G205501 Sobic008G058800--Sobic010G077500 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic008G058800--Sobic002G264200 Sobic008G058800--Sobic007G026000 Sobic008G058800--Sobic008G127400 Sobic008G058800--Sobic004G180900 Sobic004G345700--Sobic002G197100 Sobic004G345700--Sobic001G514000 Sobic004G345700--Sobic004G007300 Sobic004G345700--Sobic001G408700 Sobic005G154500 Sobic005G154500 Sobic004G345700--Sobic005G154500 Sobic001G176200 Sobic001G176200 Sobic004G345700--Sobic001G176200 Sobic004G345700--Sobic006G092800 Sobic004G345700--Sobic003G205501 Sobic004G345700--Sobic010G245000 Sobic009G129600--Sobic008G058800 Sobic009G129600--Sobic010G077500 Sobic001G346700 Sobic001G346700 Sobic009G129600--Sobic001G346700 Sobic009G129600--Sobic006G248500 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic009G129600--Sobic009G040800 Sobic002G063900 Sobic002G063900 Sobic009G129600--Sobic002G063900 Sobic008G100100 Sobic008G100100 Sobic009G129600--Sobic008G100100 Sobic002G357100 Sobic002G357100 Sobic009G129600--Sobic002G357100 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic009G129600--Sobic002G148400
Octagon: transcription factors


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