Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G013000.1
Synonym
Functional annotation transferase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PEX0
Pfam PF02458
Panther DB PTHR31896 PTHR31896:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G67150 : HXXXD-type acyl-transferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g01980.1 : transferase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040234 , Zm00025a030284
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G080540.1
Wheat TraesCS1B02G373200
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G013000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G384800 expressed protein -
2 Sobic.004G208600 glycine-rich protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G202000 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G255500 SET domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G209600 CBS domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G099000 expressed protein -
7 Sobic.008G021700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -
8 Sobic.001G495300 expressed protein -
9 Sobic.005G197300 GTP-binding protein, putative, expressed K03977: engA, GTPase
10 Sobic.004G225600 - -
11 Sobic.008G167700 expressed protein -
12 Sobic.002G081500 glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00006: glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+)
13 Sobic.004G019500 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.005G084000 expressed protein -
15 Sobic.005G022800 GTP binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G003900 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.001G054100 spo0B-associated GTP-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G246800 pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.002G402600 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G013000 Sobic007G013000 Sobic001G384800 Sobic001G384800 Sobic007G013000--Sobic001G384800 Sobic004G208600 Sobic004G208600 Sobic007G013000--Sobic004G208600 Sobic001G202000 Sobic001G202000 Sobic007G013000--Sobic001G202000 Sobic004G255500 Sobic004G255500 Sobic007G013000--Sobic004G255500 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic007G013000--Sobic002G209600 Sobic001G099000 Sobic001G099000 Sobic007G013000--Sobic001G099000 Sobic008G021700 Sobic008G021700 Sobic007G013000--Sobic008G021700 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic007G013000--Sobic001G495300 Sobic005G197300 Sobic005G197300 Sobic007G013000--Sobic005G197300 Sobic001G384800--Sobic004G208600 Sobic001G384800--Sobic007G013000 Sobic001G384800--Sobic001G495300 Sobic002G081500 Sobic002G081500 Sobic001G384800--Sobic002G081500 Sobic001G384800--Sobic001G202000 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic001G384800--Sobic005G084000 Sobic001G384800--Sobic001G099000 Sobic002G109000 Sobic002G109000 Sobic001G384800--Sobic002G109000 Sobic001G489800 Sobic001G489800 Sobic001G384800--Sobic001G489800 Sobic004G225600 Sobic004G225600 Sobic004G208600--Sobic004G225600 Sobic004G208600--Sobic001G384800 Sobic007G095500 Sobic007G095500 Sobic004G208600--Sobic007G095500 Sobic004G208600--Sobic001G202000 Sobic001G514100 Sobic001G514100 Sobic004G208600--Sobic001G514100 Sobic008G090900 Sobic008G090900 Sobic004G208600--Sobic008G090900 Sobic004G208600--Sobic001G099000 Sobic007G116100 Sobic007G116100 Sobic004G208600--Sobic007G116100 Sobic004G208600--Sobic004G255500 Sobic001G202000--Sobic004G208600 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic001G202000--Sobic001G261573 Sobic001G494500 Sobic001G494500 Sobic001G202000--Sobic001G494500 Sobic001G202000--Sobic001G384800 Sobic003G128400 Sobic003G128400 Sobic001G202000--Sobic003G128400 Sobic001G202000--Sobic007G013000 Sobic003G045300 Sobic003G045300 Sobic001G202000--Sobic003G045300 Sobic004G020800 Sobic004G020800 Sobic001G202000--Sobic004G020800 Sobic001G202000--Sobic004G225600 Sobic004G255500--Sobic001G099000 Sobic001G448600 Sobic001G448600 Sobic004G255500--Sobic001G448600 Sobic005G022800 Sobic005G022800 Sobic004G255500--Sobic005G022800 Sobic001G281500 Sobic001G281500 Sobic004G255500--Sobic001G281500 Sobic002G013700 Sobic002G013700 Sobic004G255500--Sobic002G013700 Sobic010G027200 Sobic010G027200 Sobic004G255500--Sobic010G027200 Sobic005G184300 Sobic005G184300 Sobic004G255500--Sobic005G184300 Sobic002G140000 Sobic002G140000 Sobic004G255500--Sobic002G140000 Sobic007G015300 Sobic007G015300 Sobic004G255500--Sobic007G015300 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic004G246800 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic002G209600--Sobic007G052900 Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic002G209600--Sobic006G191400 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic002G209600--Sobic001G269300 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic002G209600--Sobic009G251300 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic005G063700 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic002G209600--Sobic008G131700 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic007G076700 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic002G209600--Sobic002G330400 Sobic002G158800 Sobic002G158800 Sobic001G099000--Sobic002G158800 Sobic001G099000--Sobic005G184300 Sobic001G099000--Sobic007G015300 Sobic001G099000--Sobic002G081500 Sobic001G099000--Sobic004G255500 Sobic001G099000--Sobic010G027200 Sobic001G099000--Sobic002G109000 Sobic003G373300 Sobic003G373300 Sobic001G099000--Sobic003G373300 Sobic006G166000 Sobic006G166000 Sobic001G099000--Sobic006G166000 Sobic004G151900 Sobic004G151900 Sobic008G021700--Sobic004G151900 Sobic008G021700--Sobic009G251300 Sobic008G021700--Sobic005G022800 Sobic008G021700--Sobic004G246800 Sobic001G076200 Sobic001G076200 Sobic008G021700--Sobic001G076200 Sobic008G021700--Sobic002G209600 Sobic001G142400 Sobic001G142400 Sobic008G021700--Sobic001G142400 Sobic005G077933 Sobic005G077933 Sobic008G021700--Sobic005G077933 Sobic001G061600 Sobic001G061600 Sobic008G021700--Sobic001G061600 Sobic007G210600 Sobic007G210600 Sobic001G495300--Sobic007G210600 Sobic003G074700 Sobic003G074700 Sobic001G495300--Sobic003G074700 Sobic001G495300--Sobic005G084000 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic001G495300--Sobic003G137100 Sobic001G041800 Sobic001G041800 Sobic001G495300--Sobic001G041800 Sobic001G495300--Sobic002G109000 Sobic001G495300--Sobic001G099000 Sobic001G495300--Sobic008G131700 Sobic007G201400 Sobic007G201400 Sobic001G495300--Sobic007G201400 Sobic005G197300--Sobic005G022800 Sobic005G197300--Sobic001G514100 Sobic005G197300--Sobic001G099000 Sobic005G197300--Sobic004G255500 Sobic006G273400 Sobic006G273400 Sobic005G197300--Sobic006G273400 Sobic004G263200 Sobic004G263200 Sobic005G197300--Sobic004G263200 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic005G197300--Sobic001G022500 Sobic005G197300--Sobic002G209600 Sobic005G197300--Sobic004G225600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.