Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G043700.1
Synonym Sb08g003740
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YS73
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06280.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012950 , Zm00025a053955 , Zm00025a033685
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G014000 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
2 Sobic.001G087900 expressed protein -
3 Sobic.001G086900 potassium channel protein, putative, expressed K05389: potassium channel subfamily K, other eukaryote
4 Sobic.001G131400 thioesterase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G051000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G014000 WRKY64, expressed -
7 Sobic.003G157600 expressed protein -
8 Sobic.001G289100 cyclase/dehydrase family protein, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family
9 Sobic.003G157700 expressed protein -
10 Sobic.001G348500 expressed protein -
11 Sobic.010G122800 cadmium tolerance factor, putative, expressed -
12 Sobic.003G050200 embryo-specific 3, putative, expressed -
13 Sobic.002G425000 VQ domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G206000 WRKY68, expressed -
15 Sobic.001G237900 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.010G003600 LTPL127 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.003G228200 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
18 Sobic.008G187700 expressed protein -
19 Sobic.003G075000 expressed protein -
20 Sobic.004G319100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G043700 Sobic008G043700 Sobic006G014000 Sobic006G014000 Sobic008G043700--Sobic006G014000 Sobic001G087900 Sobic001G087900 Sobic008G043700--Sobic001G087900 Sobic001G086900 Sobic001G086900 Sobic008G043700--Sobic001G086900 Sobic001G131400 Sobic001G131400 Sobic008G043700--Sobic001G131400 Sobic004G051000 Sobic004G051000 Sobic008G043700--Sobic004G051000 Sobic005G014000 Sobic005G014000 Sobic008G043700--Sobic005G014000 Sobic003G157600 Sobic003G157600 Sobic008G043700--Sobic003G157600 Sobic001G289100 Sobic001G289100 Sobic008G043700--Sobic001G289100 Sobic003G157700 Sobic003G157700 Sobic008G043700--Sobic003G157700 Sobic003G139000 Sobic003G139000 Sobic006G014000--Sobic003G139000 Sobic006G014000--Sobic003G157700 Sobic010G122800 Sobic010G122800 Sobic006G014000--Sobic010G122800 Sobic003G215200 Sobic003G215200 Sobic006G014000--Sobic003G215200 Sobic006G008400 Sobic006G008400 Sobic006G014000--Sobic006G008400 Sobic006G014000--Sobic001G087900 Sobic007G157900 Sobic007G157900 Sobic006G014000--Sobic007G157900 Sobic001G131100 Sobic001G131100 Sobic006G014000--Sobic001G131100 Sobic006G014000--Sobic008G043700 Sobic004G351500 Sobic004G351500 Sobic001G087900--Sobic004G351500 Sobic001G428200 Sobic001G428200 Sobic001G087900--Sobic001G428200 Sobic001G353600 Sobic001G353600 Sobic001G087900--Sobic001G353600 Sobic009G131100 Sobic009G131100 Sobic001G087900--Sobic009G131100 Sobic009G198500 Sobic009G198500 Sobic001G087900--Sobic009G198500 Sobic004G272300 Sobic004G272300 Sobic001G087900--Sobic004G272300 Sobic004G026400 Sobic004G026400 Sobic001G087900--Sobic004G026400 Sobic001G095632 Sobic001G095632 Sobic001G087900--Sobic001G095632 Sobic001G034700 Sobic001G034700 Sobic001G087900--Sobic001G034700 Sobic001G018900 Sobic001G018900 Sobic001G086900--Sobic001G018900 Sobic002G414700 Sobic002G414700 Sobic001G086900--Sobic002G414700 Sobic001G036900 Sobic001G036900 Sobic001G086900--Sobic001G036900 Sobic001G295200 Sobic001G295200 Sobic001G086900--Sobic001G295200 Sobic009G215200 Sobic009G215200 Sobic001G086900--Sobic009G215200 Sobic003G429000 Sobic003G429000 Sobic001G086900--Sobic003G429000 Sobic007G018300 Sobic007G018300 Sobic001G086900--Sobic007G018300 Sobic006G141700 Sobic006G141700 Sobic001G086900--Sobic006G141700 Sobic001G402050 Sobic001G402050 Sobic001G086900--Sobic001G402050 Sobic006G180200 Sobic006G180200 Sobic001G131400--Sobic006G180200 Sobic001G131400--Sobic001G353600 Sobic010G178200 Sobic010G178200 Sobic001G131400--Sobic010G178200 Sobic009G038100 Sobic009G038100 Sobic001G131400--Sobic009G038100 Sobic001G074300 Sobic001G074300 Sobic001G131400--Sobic001G074300 Sobic009G176000 Sobic009G176000 Sobic001G131400--Sobic009G176000 Sobic004G151400 Sobic004G151400 Sobic001G131400--Sobic004G151400 Sobic008G189300 Sobic008G189300 Sobic001G131400--Sobic008G189300 Sobic010G135000 Sobic010G135000 Sobic001G131400--Sobic010G135000 Sobic004G051000--Sobic001G289100 Sobic003G305700 Sobic003G305700 Sobic004G051000--Sobic003G305700 Sobic005G061200 Sobic005G061200 Sobic004G051000--Sobic005G061200 Sobic009G232100 Sobic009G232100 Sobic004G051000--Sobic009G232100 Sobic003G250700 Sobic003G250700 Sobic004G051000--Sobic003G250700 Sobic004G051000--Sobic008G043700 Sobic010G047600 Sobic010G047600 Sobic004G051000--Sobic010G047600 Sobic001G514200 Sobic001G514200 Sobic004G051000--Sobic001G514200 Sobic004G051000--Sobic003G157700 Sobic006G019200 Sobic006G019200 Sobic005G014000--Sobic006G019200 Sobic001G039200 Sobic001G039200 Sobic005G014000--Sobic001G039200 Sobic008G144600 Sobic008G144600 Sobic005G014000--Sobic008G144600 Sobic001G237900 Sobic001G237900 Sobic005G014000--Sobic001G237900 Sobic010G226400 Sobic010G226400 Sobic005G014000--Sobic010G226400 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic005G014000--Sobic002G093700 Sobic001G487400 Sobic001G487400 Sobic005G014000--Sobic001G487400 Sobic001G340400 Sobic001G340400 Sobic005G014000--Sobic001G340400 Sobic010G003600 Sobic010G003600 Sobic005G014000--Sobic010G003600 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic003G157600--Sobic004G202400 Sobic002G042200 Sobic002G042200 Sobic003G157600--Sobic002G042200 Sobic006G197100 Sobic006G197100 Sobic003G157600--Sobic006G197100 Sobic003G184100 Sobic003G184100 Sobic003G157600--Sobic003G184100 Sobic003G384700 Sobic003G384700 Sobic003G157600--Sobic003G384700 Sobic001G416200 Sobic001G416200 Sobic003G157600--Sobic001G416200 Sobic002G261500 Sobic002G261500 Sobic003G157600--Sobic002G261500 Sobic006G122800 Sobic006G122800 Sobic003G157600--Sobic006G122800 Sobic004G349125 Sobic004G349125 Sobic003G157600--Sobic004G349125 Sobic002G320800 Sobic002G320800 Sobic001G289100--Sobic002G320800 Sobic002G115000 Sobic002G115000 Sobic001G289100--Sobic002G115000 Sobic001G289100--Sobic001G086900 Sobic003G249700 Sobic003G249700 Sobic001G289100--Sobic003G249700 Sobic003G109600 Sobic003G109600 Sobic001G289100--Sobic003G109600 Sobic001G483100 Sobic001G483100 Sobic001G289100--Sobic001G483100 Sobic001G444800 Sobic001G444800 Sobic001G289100--Sobic001G444800 Sobic001G058900 Sobic001G058900 Sobic001G289100--Sobic001G058900 Sobic001G039400 Sobic001G039400 Sobic001G289100--Sobic001G039400 Sobic002G415000 Sobic002G415000 Sobic003G157700--Sobic002G415000 Sobic001G261460 Sobic001G261460 Sobic003G157700--Sobic001G261460 Sobic003G157700--Sobic005G061200 Sobic003G206700 Sobic003G206700 Sobic003G157700--Sobic003G206700 Sobic007G047300 Sobic007G047300 Sobic003G157700--Sobic007G047300 Sobic003G157700--Sobic010G047600 Sobic009G008800 Sobic009G008800 Sobic003G157700--Sobic009G008800 Sobic001G059500 Sobic001G059500 Sobic003G157700--Sobic001G059500 Sobic001G360700 Sobic001G360700 Sobic003G157700--Sobic001G360700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.