Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G075000.1
Synonym Sb03g006330
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XQ30
Pfam -
Panther DB PTHR34670
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05064.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G075000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G024500 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G131400 thioesterase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G100600 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
4 Sobic.007G194700 phosphoribulokinase/Uridine kinase family protein, expressed K00876: udk, uridine kinase
5 Sobic.002G345850 - -
6 Sobic.005G107300 expressed protein -
7 Sobic.001G087900 expressed protein -
8 Sobic.001G072800 expressed protein -
9 Sobic.002G066400 OsFBDUF18 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G083300 OsFBL7 - F-box domain and LRR containing protein, expressed K14515: EIN3-binding F-box protein
11 Sobic.010G037300 OsMKK1 - putative MAPKK based on amino acid sequence homology, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
12 Sobic.001G463100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G209900 non-receptor tyrosine kinase spore lysis A, putative, expressed -
14 Sobic.003G271201 - -
15 Sobic.010G135000 thioredoxin reductase 2, putative, expressed K00384: trxB, thioredoxin reductase (NADPH)
16 Sobic.001G353600 expressed protein -
17 Sobic.003G290300 expressed protein -
18 Sobic.004G236300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@shikimate kinase, putative, expressed K00891: aroK, shikimate kinase
19 Sobic.001G314500 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10577: UBE2I, ubiquitin-conjugating enzyme E2 I
20 Sobic.001G032000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G075000 Sobic003G075000 Sobic001G024500 Sobic001G024500 Sobic003G075000--Sobic001G024500 Sobic001G131400 Sobic001G131400 Sobic003G075000--Sobic001G131400 Sobic006G100600 Sobic006G100600 Sobic003G075000--Sobic006G100600 Sobic007G194700 Sobic007G194700 Sobic003G075000--Sobic007G194700 Sobic002G345850 Sobic002G345850 Sobic003G075000--Sobic002G345850 Sobic005G107300 Sobic005G107300 Sobic003G075000--Sobic005G107300 Sobic001G087900 Sobic001G087900 Sobic003G075000--Sobic001G087900 Sobic001G072800 Sobic001G072800 Sobic003G075000--Sobic001G072800 Sobic002G066400 Sobic002G066400 Sobic003G075000--Sobic002G066400 Sobic001G093900 Sobic001G093900 Sobic001G024500--Sobic001G093900 Sobic008G002700 Sobic008G002700 Sobic001G024500--Sobic008G002700 Sobic007G220700 Sobic007G220700 Sobic001G024500--Sobic007G220700 Sobic002G376000 Sobic002G376000 Sobic001G024500--Sobic002G376000 Sobic010G179800 Sobic010G179800 Sobic001G024500--Sobic010G179800 Sobic001G024500--Sobic003G075000 Sobic001G075000 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Octagon: transcription factors


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