Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G107300.1
Synonym Sb05g010050
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y216
Pfam PF07939
Panther DB PTHR31865 PTHR31865:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G31560 : Protein of unknown function (DUF1685)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17930.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054493 , Zm00025a029606
Brachypodium KQJ91793
Barley HORVU4Hr1G014270.1 , HORVU4Hr1G014270.2 , HORVU4Hr1G014270.3
Wheat TraesCS4A02G233600 , TraesCS4B02G082100 , TraesCS4D02G080600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G107300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G036800 expressed protein -
2 Sobic.004G014000 serine/threonine-protein kinase Cx32, chloroplast precursor, putative, expressed -
3 Sobic.009G024600 "RSR1(Ortholog in rice:Fu and Xue, 2010)"(PubMedID : 31659916)@"AP2-like TF, coexpress with genes associated with the hormonesignaling pathway, floral development in Arabidopsis"(PubMedID : 28944535)@AP2 domain containing protein, expressed K09284: AP2-like factor, euAP2 lineage
4 Sobic.004G010300 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
5 Sobic.004G272300 expressed protein -
6 Sobic.009G230100 expressed protein -
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8 Sobic.003G299800 RING-H2 finger protein, putative, expressed K19038: E3 ubiquitin-protein ligase ATL41
9 Sobic.003G271201 - -
10 Sobic.004G209900 non-receptor tyrosine kinase spore lysis A, putative, expressed -
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12 Sobic.008G011600 ubiquitin-like protein 5, putative, expressed K13113: UBL5, ubiquitin-like protein 5
13 Sobic.001G353600 expressed protein -
14 Sobic.001G093900 stem-specific protein TSJT1, putative, expressed -
15 Sobic.001G343900 tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@ZIM domain containing protein, putative, expressed K13464: jasmonate ZIM domain-containing protein
16 Sobic.005G228000 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K12191: charged multivesicular body protein 2A
17 Sobic.001G087900 expressed protein -
18 Sobic.009G131100 transmembrane BAX inhibitor motif-containing protein, putative, expressed K06890: uncharacterized protein
19 Sobic.003G075000 expressed protein -
20 Sobic.004G308400 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic005G107300 Sobic005G107300 Sobic009G036800 Sobic009G036800 Sobic005G107300--Sobic009G036800 Sobic004G014000 Sobic004G014000 Sobic005G107300--Sobic004G014000 Sobic009G024600 Sobic009G024600 Sobic005G107300--Sobic009G024600 Sobic004G010300 Sobic004G010300 Sobic005G107300--Sobic004G010300 Sobic004G272300 Sobic004G272300 Sobic005G107300--Sobic004G272300 Sobic009G230100 Sobic009G230100 Sobic005G107300--Sobic009G230100 Sobic005G000100 Sobic005G000100 Sobic005G107300--Sobic005G000100 Sobic003G299800 Sobic003G299800 Sobic005G107300--Sobic003G299800 Sobic003G271201 Sobic003G271201 Sobic005G107300--Sobic003G271201 Sobic009G036800--Sobic005G107300 Sobic006G206700 Sobic006G206700 Sobic009G036800--Sobic006G206700 Sobic003G325500 Sobic003G325500 Sobic009G036800--Sobic003G325500 Sobic004G245200 Sobic004G245200 Sobic009G036800--Sobic004G245200 Sobic004G179700 Sobic004G179700 Sobic009G036800--Sobic004G179700 Sobic001G093900 Sobic001G093900 Sobic009G036800--Sobic001G093900 Sobic002G369800 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Octagon: transcription factors


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