Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G165600.1
Synonym
Functional annotation Protein kinase domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PE44
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27006
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G16670 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g41710.1 : Protein kinase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025347 , Zm00025a004668
Brachypodium KQJ85849 , KQJ85854 , KQJ85852 , KQJ85853 , KQJ85850 , KQJ85851
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G165600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G255700 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
2 Sobic.004G209700 FAR1 family protein, expressed -
3 Sobic.010G123600 WW domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G185800 expressed protein -
5 Sobic.003G188400 glutamate dehydrogenase protein, putative, expressed K00262: E1.4.1.4, glutamate dehydrogenase (NADP+)
6 Sobic.004G334300 ATMAK10, putative, expressed -
7 Sobic.008G088872 - -
8 Sobic.006G032300 HECT-domain domain containing protein, expressed K10590: E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12
9 Sobic.003G241100 expressed protein K07765: S2P endopeptidase
10 Sobic.005G126600 OsFBL55 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.003G433200 BAS1, putative, expressed -
12 Sobic.003G166750 - K15188: cyclin T
13 Sobic.008G054000 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G542450 - -
15 Sobic.001G433800 lissencephaly type-1-like homology motif, putative, expressed -
16 Sobic.001G207000 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
17 Sobic.006G252900 ubiquitin family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G371300 peroxisome assembly protein, putative, expressed K13346: peroxin-10
19 Sobic.007G159900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
20 Sobic.006G088200 nonsense-mediated decay UPF3, putative, expressed K14328: UPF3, regulator of nonsense transcripts 3


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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