Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G032300.1
Synonym UPL3, KAK, Sb06g003290
Functional annotation HECT-domain domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PJT3
Pfam PF00632
Panther DB PTHR11254 PTHR11254:SF73
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10590; E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12
Gene Ontology GO:0004842; ubiquitin-protein transferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38600 : HEAT repeat ;HECT-domain (ubiquitin-transferase)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g01170.1 : HECT-domain domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011978 , Zm00025a018628
Brachypodium KQJ92735 , KQJ81971 , PNT60766
Barley HORVU2Hr1G011040.2 , HORVU2Hr1G011040.3 , HORVU2Hr1G011040.1 , HORVU2Hr1G011040.6 , HORVU2Hr1G011040.7 , HORVU2Hr1G011040.4 , HORVU2Hr1G011040.5 , HORVU2Hr1G011040.8 , HORVU2Hr1G011040.9 , HORVU2Hr1G011040.10 , HORVU2Hr1G011040.11 , HORVU2Hr1G011040.12 , HORVU2Hr1G011040.13 , HORVU2Hr1G011040.14 , HORVU2Hr1G011040.15 , HORVU2Hr1G011040.16
Wheat TraesCS2B02G076900 , TraesCS2B02G076900 , TraesCS2B02G076900 , TraesCS2A02G064700 , TraesCS2A02G064700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.001G493700 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G043000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G032300 Sobic006G032300 Sobic002G335600 Sobic002G335600 Sobic006G032300--Sobic002G335600 Sobic008G088872 Sobic008G088872 Sobic006G032300--Sobic008G088872 Sobic004G053500 Sobic004G053500 Sobic006G032300--Sobic004G053500 Sobic007G018400 Sobic007G018400 Sobic006G032300--Sobic007G018400 Sobic001G273700 Sobic001G273700 Sobic006G032300--Sobic001G273700 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic006G032300--Sobic002G042600 Sobic001G191700 Sobic001G191700 Sobic006G032300--Sobic001G191700 Sobic009G131300 Sobic009G131300 Sobic006G032300--Sobic009G131300 Sobic002G429300 Sobic002G429300 Sobic006G032300--Sobic002G429300 Sobic006G184900 Sobic006G184900 Sobic002G335600--Sobic006G184900 Sobic005G162500 Sobic005G162500 Sobic002G335600--Sobic005G162500 Sobic002G335600--Sobic006G032300 Sobic002G335600--Sobic009G131300 Sobic002G335600--Sobic002G429300 Sobic001G493700 Sobic001G493700 Sobic002G335600--Sobic001G493700 Sobic002G335600--Sobic008G088872 Sobic004G040500 Sobic004G040500 Sobic002G335600--Sobic004G040500 Sobic002G335600--Sobic004G053500 Sobic008G088872--Sobic005G162500 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic008G088872--Sobic001G370900 Sobic008G088872--Sobic009G131300 Sobic008G088872--Sobic006G184900 Sobic005G062200 Sobic005G062200 Sobic008G088872--Sobic005G062200 Sobic001G263600 Sobic001G263600 Sobic008G088872--Sobic001G263600 Sobic008G088872--Sobic002G042600 Sobic008G088872--Sobic002G429300 Sobic008G088872--Sobic002G335600 Sobic002G401500 Sobic002G401500 Sobic004G053500--Sobic002G401500 Sobic002G179400 Sobic002G179400 Sobic004G053500--Sobic002G179400 Sobic004G053500--Sobic002G335600 Sobic006G166200 Sobic006G166200 Sobic004G053500--Sobic006G166200 Sobic004G053500--Sobic006G032300 Sobic005G133800 Sobic005G133800 Sobic004G053500--Sobic005G133800 Sobic002G340900 Sobic002G340900 Sobic004G053500--Sobic002G340900 Sobic003G296900 Sobic003G296900 Sobic004G053500--Sobic003G296900 Sobic004G053500--Sobic005G162500 Sobic007G018400--Sobic006G032300 Sobic001G542400 Sobic001G542400 Sobic007G018400--Sobic001G542400 Sobic002G154000 Sobic002G154000 Sobic007G018400--Sobic002G154000 Sobic007G018400--Sobic001G191700 Sobic001G299700 Sobic001G299700 Sobic007G018400--Sobic001G299700 Sobic001G400500 Sobic001G400500 Sobic007G018400--Sobic001G400500 Sobic003G043000 Sobic003G043000 Sobic007G018400--Sobic003G043000 Sobic002G399800 Sobic002G399800 Sobic007G018400--Sobic002G399800 Sobic007G018400--Sobic004G053500 Sobic007G172200 Sobic007G172200 Sobic001G273700--Sobic007G172200 Sobic001G273700--Sobic001G263600 Sobic008G099800 Sobic008G099800 Sobic001G273700--Sobic008G099800 Sobic001G347500 Sobic001G347500 Sobic001G273700--Sobic001G347500 Sobic007G133700 Sobic007G133700 Sobic001G273700--Sobic007G133700 Sobic007G163100 Sobic007G163100 Sobic001G273700--Sobic007G163100 Sobic001G457900 Sobic001G457900 Sobic001G273700--Sobic001G457900 Sobic001G313700 Sobic001G313700 Sobic001G273700--Sobic001G313700 Sobic001G273700--Sobic002G042600 Sobic001G065100 Sobic001G065100 Sobic002G042600--Sobic001G065100 Sobic002G042600--Sobic006G184900 Sobic008G098900 Sobic008G098900 Sobic002G042600--Sobic008G098900 Sobic002G042600--Sobic002G401500 Sobic002G042600--Sobic002G179400 Sobic004G322400 Sobic004G322400 Sobic002G042600--Sobic004G322400 Sobic002G042600--Sobic002G429300 Sobic002G042600--Sobic008G088872 Sobic002G042600--Sobic001G370900 Sobic001G191700--Sobic001G299700 Sobic001G191700--Sobic001G542400 Sobic001G004400 Sobic001G004400 Sobic001G191700--Sobic001G004400 Sobic001G191700--Sobic005G162500 Sobic001G191700--Sobic001G400500 Sobic009G109200 Sobic009G109200 Sobic001G191700--Sobic009G109200 Sobic004G248600 Sobic004G248600 Sobic001G191700--Sobic004G248600 Sobic001G191700--Sobic006G032300 Sobic001G117200 Sobic001G117200 Sobic001G191700--Sobic001G117200 Sobic009G131300--Sobic002G429300 Sobic009G131300--Sobic002G401500 Sobic009G131300--Sobic005G162500 Sobic009G131300--Sobic008G088872 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic009G131300--Sobic010G059500 Sobic009G131300--Sobic008G098900 Sobic009G131300--Sobic006G184900 Sobic009G131300--Sobic001G493700 Sobic009G084900 Sobic009G084900 Sobic009G131300--Sobic009G084900 Sobic002G429300--Sobic009G131300 Sobic002G429300--Sobic005G162500 Sobic002G429300--Sobic006G184900 Sobic002G429300--Sobic001G263600 Sobic002G429300--Sobic002G042600 Sobic002G429300--Sobic008G098900 Sobic002G429300--Sobic001G493700 Sobic002G429300--Sobic002G335600 Sobic002G429300--Sobic008G088872
Octagon: transcription factors


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