Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G174700.2
Synonym Sb09g023530, STN8
Functional annotation serine/threonine-protein kinase stt7, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R386
Pfam PF00069
Panther DB PTHR11584
NCBI CDD KOG0594; Protein kinase PCTAIRE and related kinases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01920 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g40180.1 : serine/threonine-protein kinase stt7, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044005
Brachypodium KQK05739
Barley HORVU1Hr1G069560.5 , HORVU1Hr1G069560.4 , HORVU1Hr1G069560.1 , HORVU1Hr1G069560.2 , HORVU1Hr1G069560.3
Wheat TraesCS1A02G301400 , TraesCS1D02G301100 , TraesCS1B02G311200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G174700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G174700 Sobic009G174700 Sobic002G133900 Sobic002G133900 Sobic009G174700--Sobic002G133900 Sobic010G201600 Sobic010G201600 Sobic009G174700--Sobic010G201600 Sobic002G405100 Sobic002G405100 Sobic009G174700--Sobic002G405100 Sobic001G175700 Sobic001G175700 Sobic009G174700--Sobic001G175700 Sobic006G235350 Sobic006G235350 Sobic009G174700--Sobic006G235350 Sobic009G131800 Sobic009G131800 Sobic009G174700--Sobic009G131800 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic009G174700--Sobic002G272100 Sobic002G233700 Sobic002G233700 Sobic009G174700--Sobic002G233700 Sobic003G070900 Sobic003G070900 Sobic009G174700--Sobic003G070900 Sobic002G133900--Sobic003G070900 Sobic003G094350 Sobic003G094350 Sobic002G133900--Sobic003G094350 Sobic003G287900 Sobic003G287900 Sobic002G133900--Sobic003G287900 Sobic002G133900--Sobic002G405100 Sobic004G353100 Sobic004G353100 Sobic002G133900--Sobic004G353100 Sobic005G100300 Sobic005G100300 Sobic002G133900--Sobic005G100300 Sobic002G028400 Sobic002G028400 Sobic002G133900--Sobic002G028400 Sobic007G103400 Sobic007G103400 Sobic002G133900--Sobic007G103400 Sobic009G170200 Sobic009G170200 Sobic002G133900--Sobic009G170200 Sobic010G201600--Sobic005G100300 Sobic010G201600--Sobic002G405100 Sobic001G128600 Sobic001G128600 Sobic010G201600--Sobic001G128600 Sobic010G201600--Sobic002G133900 Sobic010G201600--Sobic002G233700 Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic010G201600--Sobic002G401800 Sobic004G303200 Sobic004G303200 Sobic010G201600--Sobic004G303200 Sobic007G052400 Sobic007G052400 Sobic010G201600--Sobic007G052400 Sobic010G201600--Sobic003G094350 Sobic002G405100--Sobic002G133900 Sobic002G405100--Sobic005G100300 Sobic002G405100--Sobic002G401800 Sobic002G405100--Sobic004G353100 Sobic010G035400 Sobic010G035400 Sobic002G405100--Sobic010G035400 Sobic002G405100--Sobic010G201600 Sobic002G405100--Sobic003G094350 Sobic004G336200 Sobic004G336200 Sobic002G405100--Sobic004G336200 Sobic002G405100--Sobic007G052400 Sobic006G050400 Sobic006G050400 Sobic001G175700--Sobic006G050400 Sobic001G175700--Sobic009G131800 Sobic004G012900 Sobic004G012900 Sobic001G175700--Sobic004G012900 Sobic001G405700 Sobic001G405700 Sobic001G175700--Sobic001G405700 Sobic001G175700--Sobic002G233700 Sobic003G342200 Sobic003G342200 Sobic001G175700--Sobic003G342200 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic001G175700--Sobic001G083100 Sobic004G253400 Sobic004G253400 Sobic001G175700--Sobic004G253400 Sobic006G155500 Sobic006G155500 Sobic001G175700--Sobic006G155500 Sobic006G140500 Sobic006G140500 Sobic006G235350--Sobic006G140500 Sobic004G202200 Sobic004G202200 Sobic006G235350--Sobic004G202200 Sobic007G166300 Sobic007G166300 Sobic006G235350--Sobic007G166300 Sobic005G028800 Sobic005G028800 Sobic006G235350--Sobic005G028800 Sobic003G005000 Sobic003G005000 Sobic006G235350--Sobic003G005000 Sobic001G289500 Sobic001G289500 Sobic006G235350--Sobic001G289500 Sobic002G223700 Sobic002G223700 Sobic006G235350--Sobic002G223700 Sobic001G015200 Sobic001G015200 Sobic006G235350--Sobic001G015200 Sobic009G132000 Sobic009G132000 Sobic006G235350--Sobic009G132000 Sobic009G131800--Sobic001G175700 Sobic004G055000 Sobic004G055000 Sobic009G131800--Sobic004G055000 Sobic009G131800--Sobic002G272100 Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic009G131800--Sobic004G020300 Sobic004G343000 Sobic004G343000 Sobic009G131800--Sobic004G343000 Sobic009G131800--Sobic001G405700 Sobic008G172700 Sobic008G172700 Sobic009G131800--Sobic008G172700 Sobic003G408000 Sobic003G408000 Sobic009G131800--Sobic003G408000 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic009G131800--Sobic002G267900 Sobic002G272100--Sobic002G401800 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic002G272100--Sobic008G073100 Sobic001G368500 Sobic001G368500 Sobic002G272100--Sobic001G368500 Sobic008G050400 Sobic008G050400 Sobic002G272100--Sobic008G050400 Sobic008G039600 Sobic008G039600 Sobic002G272100--Sobic008G039600 Sobic002G351600 Sobic002G351600 Sobic002G272100--Sobic002G351600 Sobic002G272100--Sobic002G267900 Sobic002G272100--Sobic001G083100 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic002G272100--Sobic005G110400 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic002G233700--Sobic008G171300 Sobic002G233700--Sobic004G012900 Sobic002G233700--Sobic004G303200 Sobic002G233700--Sobic007G052400 Sobic007G225500 Sobic007G225500 Sobic002G233700--Sobic007G225500 Sobic001G005200 Sobic001G005200 Sobic002G233700--Sobic001G005200 Sobic003G002300 Sobic003G002300 Sobic002G233700--Sobic003G002300 Sobic002G233700--Sobic002G401800 Sobic003G378600 Sobic003G378600 Sobic002G233700--Sobic003G378600 Sobic003G070900--Sobic002G133900 Sobic003G070900--Sobic003G287900 Sobic003G070900--Sobic009G170200 Sobic003G070900--Sobic003G094350 Sobic001G118400 Sobic001G118400 Sobic003G070900--Sobic001G118400 Sobic001G500600 Sobic001G500600 Sobic003G070900--Sobic001G500600 Sobic003G070900--Sobic004G353100 Sobic008G074000 Sobic008G074000 Sobic003G070900--Sobic008G074000 Sobic008G006100 Sobic008G006100 Sobic003G070900--Sobic008G006100
Octagon: transcription factors


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