Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G049000.6,Sobic.010G049000.2,Sobic.010G049000.9
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YIE4 , A0A194YIE0
Pfam -
Panther DB PTHR23273 PTHR23273:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06230.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G172300 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2
2 Sobic.009G014100 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G150100 HD domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G110532 - -
5 Sobic.001G465700 aminotransferase, putative, expressed K00833: adenosylmethionine---8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
6 Sobic.008G039900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@-(PubMedID : 26976818)@glycine dehydrogenase, putative, expressed K00281: GLDC, glycine dehydrogenase
7 Sobic.001G003200 RNApolymerase sigma-subunit F(PubMedID : 26465154)@RNA polymerase sigma factor, putative, expressed K03086: RNA polymerase primary sigma factor
8 Sobic.003G108900 -(PubMedID : 26465154)@peptidase, putative, expressed -
9 Sobic.006G219150 - -
10 Sobic.002G073200 peptidase, M24 family protein, putative, expressed K01262: Xaa-Pro aminopeptidase
11 Sobic.003G340600 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G072700 expressed protein -
13 Sobic.002G000700 expressed protein -
14 Sobic.006G270700 - -
15 Sobic.004G263400 expressed protein -
16 Sobic.004G026500 expressed protein -
17 Sobic.009G175500 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
18 Sobic.006G038500 tRNA-dihydrouridine synthase, putative, expressed K05539: tRNA-dihydrouridine synthase A
19 Sobic.007G111400 - -
20 Sobic.005G100600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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