Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G060900.1
Synonym Sb10g005280
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VRN6
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g06750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ92718 , KQJ92714
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G092800 - -
2 Sobic.006G092400 calmodulin binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.007G001200 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed K08515: vesicle-associated membrane protein 7
4 Sobic.008G047400 OsFBT14 - F-box and tubby domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G031900 OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G306500 OsMADS22 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
7 Sobic.003G302900 transcriptional regulator family protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G441400 transcription factor, putative, expressed K09060: plant G-box-binding factor
10 Sobic.010G025850 - -
11 Sobic.001G333600 membrane-anchored ubiquitin-fold protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G321100 SAC domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G061900 AT hook motif domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G220800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
15 Sobic.010G130000 expressed protein K12199: VTA1, vacuolar protein sorting-associated protein VTA1
16 Sobic.003G139900 "Highest expression level in embryo, up-regulation in roots in response to exogenous ABA and PEG"(PubMedID : 27501690)@OsSPL1 - SBP-box gene family member, expressed -
17 Sobic.009G080700 expressed protein -
18 Sobic.001G388250 - -
19 Sobic.001G481800 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
20 Sobic.010G064500 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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