Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G080700.1
Synonym Sb09g006935
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P7D7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G46220 : Uncharacterized conserved protein (DUF2358)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g12474.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G080700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G034100 D-alanine--D-alanine ligase family, putative, expressed -
2 Sobic.001G100900 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
3 Sobic.001G481800 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
4 Sobic.003G043200 EMB2410, putative, expressed -
5 Sobic.004G306500 OsMADS22 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
6 Sobic.005G110300 - -
7 Sobic.006G222600 AT hook motif family protein, expressed -
8 Sobic.010G100516 - -
9 Sobic.010G025850 - -
10 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
11 Sobic.004G174200 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
12 Sobic.002G027166 - -
13 Sobic.005G084500 uncharacterized protein yqxC, putative, expressed K06442: 23S rRNA (cytidine1920-2'-O)/16S rRNA (cytidine1409-2'-O)-methyltransferase
14 Sobic.009G256400 ATP binding protein, putative, expressed K15192: BTAF1, TATA-binding protein-associated factor
15 Sobic.005G110200 - -
16 Sobic.002G376600 paramyosin, putative, expressed -
17 Sobic.003G190400 rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake, putative, expressed -
18 Sobic.004G010151 - -
19 Sobic.004G042200 OsFBO8 - F-box and other domain containing protein, expressed K12115: clock-associated PAS protein ZTL
20 Sobic.007G031900 OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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