Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G172900.1
Synonym HDA2, Sb10g022550
Functional annotation histone deacetylase, putative, expressed
UniProt C5Z527
Pfam PF00850
Panther DB PTHR10625 PTHR10625:SF112
NCBI CDD KOG1344; Predicted histone deacetylase
KEGG Orthology K11418; histone deacetylase 11
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26040 : histone deacetylase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g37420.1 : histone deacetylase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051125
Brachypodium KQK17906 , KQK17905
Barley HORVU0Hr1G021740.4 , HORVU0Hr1G021740.1 , HORVU0Hr1G021740.2 , HORVU0Hr1G021740.3
Wheat TraesCS7B02G266000 , TraesCS7D02G360500 , TraesCS7D02G360500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G172900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.003G296900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G172900 Sobic010G172900 Sobic005G026000 Sobic005G026000 Sobic010G172900--Sobic005G026000 Sobic002G167500 Sobic002G167500 Sobic010G172900--Sobic002G167500 Sobic003G310300 Sobic003G310300 Sobic010G172900--Sobic003G310300 Sobic001G532600 Sobic001G532600 Sobic010G172900--Sobic001G532600 Sobic003G107500 Sobic003G107500 Sobic010G172900--Sobic003G107500 Sobic002G376600 Sobic002G376600 Sobic010G172900--Sobic002G376600 Sobic003G043200 Sobic003G043200 Sobic010G172900--Sobic003G043200 Sobic003G105900 Sobic003G105900 Sobic010G172900--Sobic003G105900 Sobic008G172300 Sobic008G172300 Sobic010G172900--Sobic008G172300 Sobic010G100800 Sobic010G100800 Sobic005G026000--Sobic010G100800 Sobic003G311900 Sobic003G311900 Sobic005G026000--Sobic003G311900 Sobic004G262700 Sobic004G262700 Sobic005G026000--Sobic004G262700 Sobic005G026000--Sobic002G167500 Sobic004G344000 Sobic004G344000 Sobic005G026000--Sobic004G344000 Sobic001G124100 Sobic001G124100 Sobic005G026000--Sobic001G124100 Sobic003G264800 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Octagon: transcription factors


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