Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G026000.1,Sobic.005G026000.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y432 , A0A1Z5RGJ4
Pfam PF05904
Panther DB PTHR33167 PTHR33167:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G12120 : Plant protein of unknown function (DUF863)
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g40580.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G026000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G100800 alpha-mannosidase 2, putative, expressed K01231: alpha-mannosidase II
2 Sobic.003G311900 CK1_CaseinKinase_1a.3 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
3 Sobic.004G262700 - -
4 Sobic.002G167500 expressed protein -
5 Sobic.004G344000 expressed protein -
6 Sobic.001G124100 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, putative, expressed K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
7 Sobic.003G264800 expressed protein -
8 Sobic.001G049500 - K11594: DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X
9 Sobic.003G107500 expressed protein K10841: ERCC6, CSB, DNA excision repair protein ERCC-6
10 Sobic.001G402500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
11 Sobic.001G501300 cell division control protein 48 homolog E, putative, expressed K13525: VCP, transitional endoplasmic reticulum ATPase
12 Sobic.003G193200 expressed protein -
13 Sobic.008G033900 PHD-finger family protein, expressed -
14 Sobic.003G186900 - K12812: DDX39B, UAP56, ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
15 Sobic.005G199400 glutathione synthetase, chloroplast precursor, putative, expressed K01920: glutathione synthase
16 Sobic.005G187300 lipin, N-terminal conserved region family protein, expressed K15728: phosphatidate phosphatase LPIN
17 Sobic.009G162600 OsFtsH8 FtsH protease, homologue of AtFtsH3/10, expressed K08956: AFG3 family protein
18 Sobic.005G142800 exportin 1, putative, expressed K15436: TRPO3, transportin-3
19 Sobic.010G172900 histone deacetylase, putative, expressed K11418: histone deacetylase 11
20 Sobic.003G340600 VHS and GAT domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G026000 Sobic005G026000 Sobic010G100800 Sobic010G100800 Sobic005G026000--Sobic010G100800 Sobic003G311900 Sobic003G311900 Sobic005G026000--Sobic003G311900 Sobic004G262700 Sobic004G262700 Sobic005G026000--Sobic004G262700 Sobic002G167500 Sobic002G167500 Sobic005G026000--Sobic002G167500 Sobic004G344000 Sobic004G344000 Sobic005G026000--Sobic004G344000 Sobic001G124100 Sobic001G124100 Sobic005G026000--Sobic001G124100 Sobic003G264800 Sobic003G264800 Sobic005G026000--Sobic003G264800 Sobic001G049500 Sobic001G049500 Sobic005G026000--Sobic001G049500 Sobic003G107500 Sobic003G107500 Sobic005G026000--Sobic003G107500 Sobic001G501300 Sobic001G501300 Sobic010G100800--Sobic001G501300 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic010G100800--Sobic001G261900 Sobic010G100800--Sobic005G026000 Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic010G100800--Sobic001G300100 Sobic002G404200 Sobic002G404200 Sobic010G100800--Sobic002G404200 Sobic010G086900 Sobic010G086900 Sobic010G100800--Sobic010G086900 Sobic002G031700 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Octagon: transcription factors


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