Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G181800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VTT5
Pfam PF11321
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G318400 MTD1, putative, expressed -
2 Sobic.004G274500 OsFBD8 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G064200 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G117700 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
5 Sobic.002G174500 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G070298 Cell wall invertase enzyme activity(PubMedID : 17293002) K01193: INV, beta-fructofuranosidase
7 Sobic.007G208200 expressed protein -
8 Sobic.010G196800 OsFBX436 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G208800 aspartic proteinase, putative, expressed -
10 Sobic.009G170800 "Phylogenetic analysis of canonical DREB1 and DREB2 genes in sorghum with those genes in maize, rice, and Arabidopsis. "(PubMedID : 24086146)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G193700 expressed protein -
12 Sobic.001G322832 - -
13 Sobic.004G056201 - -
14 Sobic.007G018000 expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.006G066600 DNA-binding protein S1FA, putative, expressed -
16 Sobic.001G154400 expp1 protein precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G324300 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
18 Sobic.003G057650 - -
19 Sobic.002G113500 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./late senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@RALFL4 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
20 Sobic.005G185200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G181800 Sobic010G181800 Sobic004G318400 Sobic004G318400 Sobic010G181800--Sobic004G318400 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic010G181800--Sobic004G274500 Sobic005G064200 Sobic005G064200 Sobic010G181800--Sobic005G064200 Sobic009G117700 Sobic009G117700 Sobic010G181800--Sobic009G117700 Sobic002G174500 Sobic002G174500 Sobic010G181800--Sobic002G174500 Sobic006G070298 Sobic006G070298 Sobic010G181800--Sobic006G070298 Sobic007G208200 Sobic007G208200 Sobic010G181800--Sobic007G208200 Sobic010G196800 Sobic010G196800 Sobic010G181800--Sobic010G196800 Sobic003G208800 Sobic003G208800 Sobic010G181800--Sobic003G208800 Sobic004G102900 Sobic004G102900 Sobic004G318400--Sobic004G102900 Sobic004G318400--Sobic007G208200 Sobic003G304500 Sobic003G304500 Sobic004G318400--Sobic003G304500 Sobic004G318400--Sobic004G274500 Sobic006G066600 Sobic006G066600 Sobic004G318400--Sobic006G066600 Sobic004G196800 Sobic004G196800 Sobic004G318400--Sobic004G196800 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic004G318400--Sobic009G025100 Sobic004G155300 Sobic004G155300 Sobic004G318400--Sobic004G155300 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic004G318400--Sobic007G194100 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic004G274500--Sobic010G037200 Sobic004G274500--Sobic009G025100 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic004G274500--Sobic001G394900 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G274500--Sobic003G402100 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic004G274500--Sobic001G170500 Sobic004G274500--Sobic003G304500 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic004G274500--Sobic008G039700 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic004G274500--Sobic003G303500 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic004G274500--Sobic008G037100 Sobic007G018000 Sobic007G018000 Sobic005G064200--Sobic007G018000 Sobic003G324300 Sobic003G324300 Sobic005G064200--Sobic003G324300 Sobic005G064200--Sobic004G318400 Sobic005G064200--Sobic007G208200 Sobic005G098700 Sobic005G098700 Sobic005G064200--Sobic005G098700 Sobic001G050900 Sobic001G050900 Sobic005G064200--Sobic001G050900 Sobic009G199300 Sobic009G199300 Sobic005G064200--Sobic009G199300 Sobic005G064200--Sobic007G194100 Sobic005G064200--Sobic010G196800 Sobic001G220600 Sobic001G220600 Sobic009G117700--Sobic001G220600 Sobic009G117700--Sobic008G037100 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic009G117700--Sobic006G080200 Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic009G117700--Sobic001G301100 Sobic004G292833 Sobic004G292833 Sobic009G117700--Sobic004G292833 Sobic005G003001 Sobic005G003001 Sobic009G117700--Sobic005G003001 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic009G117700--Sobic010G200100 Sobic009G117700--Sobic004G274500 Sobic008G164101 Sobic008G164101 Sobic009G117700--Sobic008G164101 Sobic002G147466 Sobic002G147466 Sobic002G174500--Sobic002G147466 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic002G174500--Sobic004G322901 Sobic010G207900 Sobic010G207900 Sobic002G174500--Sobic010G207900 Sobic007G126000 Sobic007G126000 Sobic002G174500--Sobic007G126000 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic002G174500--Sobic005G083280 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic002G174500--Sobic001G261529 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic002G174500--Sobic006G018751 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic002G174500--Sobic009G014900 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic002G174500--Sobic007G086701 Sobic006G274400 Sobic006G274400 Sobic006G070298--Sobic006G274400 Sobic002G359700 Sobic002G359700 Sobic006G070298--Sobic002G359700 Sobic002G051700 Sobic002G051700 Sobic006G070298--Sobic002G051700 Sobic001G189000 Sobic001G189000 Sobic006G070298--Sobic001G189000 Sobic009G242700 Sobic009G242700 Sobic006G070298--Sobic009G242700 Sobic004G063500 Sobic004G063500 Sobic006G070298--Sobic004G063500 Sobic006G070298--Sobic005G064200 Sobic006G070298--Sobic010G196800 Sobic001G162800 Sobic001G162800 Sobic006G070298--Sobic001G162800 Sobic007G208200--Sobic003G324300 Sobic007G208200--Sobic004G318400 Sobic007G208200--Sobic004G102900 Sobic007G208200--Sobic007G194100 Sobic007G208200--Sobic009G199300 Sobic007G150700 Sobic007G150700 Sobic007G208200--Sobic007G150700 Sobic007G208200--Sobic003G304500 Sobic007G182500 Sobic007G182500 Sobic007G208200--Sobic007G182500 Sobic007G208200--Sobic005G064200 Sobic003G325700 Sobic003G325700 Sobic010G196800--Sobic003G325700 Sobic009G131400 Sobic009G131400 Sobic010G196800--Sobic009G131400 Sobic010G196800--Sobic001G050900 Sobic003G146400 Sobic003G146400 Sobic010G196800--Sobic003G146400 Sobic010G196800--Sobic005G064200 Sobic008G111500 Sobic008G111500 Sobic010G196800--Sobic008G111500 Sobic009G216800 Sobic009G216800 Sobic010G196800--Sobic009G216800 Sobic009G170800 Sobic009G170800 Sobic010G196800--Sobic009G170800 Sobic001G389900 Sobic001G389900 Sobic010G196800--Sobic001G389900 Sobic006G263400 Sobic006G263400 Sobic003G208800--Sobic006G263400 Sobic001G123300 Sobic001G123300 Sobic003G208800--Sobic001G123300 Sobic001G081800 Sobic001G081800 Sobic003G208800--Sobic001G081800 Sobic002G351100 Sobic002G351100 Sobic003G208800--Sobic002G351100 Sobic010G212700 Sobic010G212700 Sobic003G208800--Sobic010G212700 Sobic001G171100 Sobic001G171100 Sobic003G208800--Sobic001G171100 Sobic001G081100 Sobic001G081100 Sobic003G208800--Sobic001G081100 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic003G208800--Sobic002G343000 Sobic002G109100 Sobic002G109100 Sobic003G208800--Sobic002G109100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.