Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G264100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YLM0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01360.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G264100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G041700 TLD family protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G300400 serine/threonine-protein kinase CTR1, putative, expressed -
3 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G413500 expressed protein -
5 Sobic.001G094000 expressed protein -
6 Sobic.001G168400 similar to Serine/threonine-protein kinase SAPK10(PubMedID : 29862293)@CAMK_CAMK_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
7 Sobic.009G134500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11801: DDB1- and CUL4-associated factor 11
8 Sobic.005G149500 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
9 Sobic.001G477800 expressed protein -
10 Sobic.007G011400 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G246900 expressed protein -
12 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
13 Sobic.008G024600 expressed protein -
14 Sobic.007G037900 oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold containing protein, expressed -
15 Sobic.006G209850 - -
16 Sobic.002G144933 - -
17 Sobic.002G203200 - -
18 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
19 Sobic.010G129200 - -
20 Sobic.003G187400 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2


Gene co-expression network
sample Sobic010G264100 Sobic010G264100 Sobic008G041700 Sobic008G041700 Sobic010G264100--Sobic008G041700 Sobic002G300400 Sobic002G300400 Sobic010G264100--Sobic002G300400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic010G264100--Sobic003G268300 Sobic001G413500 Sobic001G413500 Sobic010G264100--Sobic001G413500 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic010G264100--Sobic001G094000 Sobic001G168400 Sobic001G168400 Sobic010G264100--Sobic001G168400 Sobic009G134500 Sobic009G134500 Sobic010G264100--Sobic009G134500 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic010G264100--Sobic005G149500 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic010G264100--Sobic001G477800 Sobic008G041700--Sobic009G134500 Sobic008G041700--Sobic010G264100 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G041700--Sobic007G011400 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic008G041700--Sobic005G187200 Sobic008G041700--Sobic005G149500 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic008G041700--Sobic002G283300 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic008G041700--Sobic007G137900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic008G041700--Sobic010G263800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic008G041700--Sobic010G026400 Sobic010G001600 Sobic010G001600 Sobic002G300400--Sobic010G001600 Sobic006G124900 Sobic006G124900 Sobic002G300400--Sobic006G124900 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic002G300400--Sobic001G543800 Sobic002G300400--Sobic010G264100 Sobic008G160700 Sobic008G160700 Sobic002G300400--Sobic008G160700 Sobic002G165300 Sobic002G165300 Sobic002G300400--Sobic002G165300 Sobic005G177800 Sobic005G177800 Sobic002G300400--Sobic005G177800 Sobic007G130600 Sobic007G130600 Sobic002G300400--Sobic007G130600 Sobic001G194900 Sobic001G194900 Sobic002G300400--Sobic001G194900 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic009G083900 Sobic009G083900 Sobic001G413500--Sobic009G083900 Sobic001G413500--Sobic008G173900 Sobic001G413500--Sobic002G157000 Sobic004G240800 Sobic004G240800 Sobic001G413500--Sobic004G240800 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic001G413500--Sobic001G497300 Sobic005G023900 Sobic005G023900 Sobic001G413500--Sobic005G023900 Sobic001G413500--Sobic003G200200 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic001G413500--Sobic004G145500 Sobic001G413500--Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic001G168400--Sobic010G264100 Sobic001G168400--Sobic008G041700 Sobic001G168400--Sobic007G011400 Sobic001G168400--Sobic009G040700 Sobic001G168400--Sobic002G300400 Sobic001G168400--Sobic003G187400 Sobic001G168400--Sobic001G094000 Sobic001G486300 Sobic001G486300 Sobic001G168400--Sobic001G486300 Sobic001G168400--Sobic005G149500 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic009G134500--Sobic006G246900 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic009G134500--Sobic006G082600 Sobic009G134500--Sobic009G127900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic009G134500--Sobic001G162300 Sobic009G134500--Sobic002G157000 Sobic009G134500--Sobic008G041700 Sobic009G134500--Sobic005G187200 Sobic009G134500--Sobic007G037900 Sobic009G134500--Sobic007G178700 Sobic005G149500--Sobic003G187400 Sobic005G149500--Sobic002G157300 Sobic005G149500--Sobic009G040700 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic005G149500--Sobic004G196700 Sobic005G149500--Sobic007G011400 Sobic006G060100 Sobic006G060100 Sobic005G149500--Sobic006G060100 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic005G149500--Sobic007G185900 Sobic005G149500--Sobic007G137900 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic005G149500--Sobic007G078000 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic004G031700 Sobic001G477800--Sobic001G094000 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic001G477800--Sobic001G544200 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic006G080300 Sobic001G477800--Sobic009G040700 Sobic001G477800--Sobic007G011400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G477800--Sobic006G009400
Octagon: transcription factors


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