Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G012100.2,Sobic.001G012100.3,Sobic.001G012100.1
Synonym Sb01g001170
Functional annotation oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S471 , C5WSW3 , A0A1Z5S3U3
Pfam PF00106
Panther DB PTHR24322 PTHR24322:SF378 PTHR24322
NCBI CDD KOG0725; Reductases with broad range of substrate specificities
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01980 : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g63290.1 : oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016330
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G549100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G012100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G142066 - K18045: SIW14, tyrosine-protein phosphatase SIW14
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20 Sobic.001G006400 DANA2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G012100 Sobic001G012100 Sobic002G142066 Sobic002G142066 Sobic001G012100--Sobic002G142066 Sobic004G117800 Sobic004G117800 Sobic001G012100--Sobic004G117800 Sobic001G416300 Sobic001G416300 Sobic001G012100--Sobic001G416300 Sobic010G080300 Sobic010G080300 Sobic001G012100--Sobic010G080300 Sobic009G190800 Sobic009G190800 Sobic001G012100--Sobic009G190800 Sobic007G132500 Sobic007G132500 Sobic001G012100--Sobic007G132500 Sobic009G141400 Sobic009G141400 Sobic001G012100--Sobic009G141400 Sobic004G018400 Sobic004G018400 Sobic001G012100--Sobic004G018400 Sobic006G052200 Sobic006G052200 Sobic001G012100--Sobic006G052200 Sobic002G404200 Sobic002G404200 Sobic002G142066--Sobic002G404200 Sobic004G224500 Sobic004G224500 Sobic002G142066--Sobic004G224500 Sobic002G142066--Sobic009G141400 Sobic008G063200 Sobic008G063200 Sobic002G142066--Sobic008G063200 Sobic006G214700 Sobic006G214700 Sobic002G142066--Sobic006G214700 Sobic003G179400 Sobic003G179400 Sobic002G142066--Sobic003G179400 Sobic001G006000 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Octagon: transcription factors


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