Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G287000.2,Sobic.001G287000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QLN8 , A0A1B6QLN5
Pfam -
Panther DB PTHR33065:SF19 PTHR33065 PTHR33065 PTHR33065:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g38290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G140800 , TraesCS5A02G282100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G057400 expressed protein K16586: HAUS augmin-like complex subunit 3
2 Sobic.001G270700 nodulin, putative, expressed -
3 Sobic.003G141600 - -
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8 Sobic.003G385300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G252300 expressed protein -
10 Sobic.001G257800 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
11 Sobic.001G057400 expressed protein -
12 Sobic.001G179800 alpha-soluble NSF attachment protein, putative, expressed K15296: NAPA, SNAPA, alpha-soluble NSF attachment protein
13 Sobic.004G176200 SacI homology domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G103800 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
15 Sobic.004G178700 protein transport protein Sec61, putative, expressed K10956: protein transport protein SEC61 subunit alpha
16 Sobic.007G142600 DUF593 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G102300 - -
18 Sobic.010G116700 - -
19 Sobic.005G171700 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G055500 Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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