Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G490100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQ90
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g26070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002662
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G066100 conserved hypothetical protein -
2 Sobic.004G004100 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G225500 expressed protein -
4 Sobic.010G161000 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.26 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07198: PRKAA, 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit
5 Sobic.002G350200 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
6 Sobic.005G110424 - -
7 Sobic.008G036600 expressed protein -
8 Sobic.002G060000 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G318900 stage II sporulation protein E, putative, expressed -
10 Sobic.002G078200 - -
11 Sobic.008G180000 - -
12 Sobic.003G156900 expressed protein -
13 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G389600 transcription regulator, putative, expressed -
15 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -
16 Sobic.005G185900 expressed protein -
17 Sobic.005G170400 OsFBDUF58 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G223700 - -
19 Sobic.008G017850 - -
20 Sobic.009G007300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G490100 Sobic001G490100 Sobic006G066100 Sobic006G066100 Sobic001G490100--Sobic006G066100 Sobic004G004100 Sobic004G004100 Sobic001G490100--Sobic004G004100 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic001G490100--Sobic005G225500 Sobic010G161000 Sobic010G161000 Sobic001G490100--Sobic010G161000 Sobic002G350200 Sobic002G350200 Sobic001G490100--Sobic002G350200 Sobic005G110424 Sobic005G110424 Sobic001G490100--Sobic005G110424 Sobic008G036600 Sobic008G036600 Sobic001G490100--Sobic008G036600 Sobic002G060000 Sobic002G060000 Sobic001G490100--Sobic002G060000 Sobic004G318900 Sobic004G318900 Sobic001G490100--Sobic004G318900 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic006G066100--Sobic007G142801 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic006G066100--Sobic009G242200 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic006G066100--Sobic001G172100 Sobic005G026700 Sobic005G026700 Sobic006G066100--Sobic005G026700 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic006G066100--Sobic003G297100 Sobic005G002100 Sobic005G002100 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Octagon: transcription factors


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