Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G503200.5,Sobic.001G503200.3,Sobic.001G503200.6,Sobic.001G503200.7,Sobic.001G503200.4,Sobic.001G503200.1,Sobic.001G503200.2
Synonym REF6, Sb01g047010
Functional annotation ZOS3-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5WXX2 , A0A1Z5SBJ6
Pfam -
Panther DB PTHR10694 PTHR10694:SF45
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48430 : relative of early flowering 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05480.1 : ZOS3-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053420 , Zm00025a000660
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G031500 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G188600 expressed protein -
3 Sobic.003G272700 transmembrane protein 16K, putative, expressed -
4 Sobic.003G360300 exostosin family domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G032600 - -
6 Sobic.001G191900 mitochondrial carrier protein, putative, expressed K15109: SLC25A20_29, CACT, CACL, solute carrier family 25 (mitochondrial carnitine/acylcarnitine transporter), member 20/29
7 Sobic.002G076100 transcription factor, putative, expressed K09060: plant G-box-binding factor
8 Sobic.004G356200 expressed protein -
9 Sobic.003G050700 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
10 Sobic.002G252100 methyl-binding domain protein MBD, putative, expressed -
11 Sobic.002G162500 - -
12 Sobic.008G078000 EDM2, putative, expressed -
13 Sobic.010G233000 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
14 Sobic.008G063600 glycosyl hydrolase family protein 27, putative, expressed -
15 Sobic.004G177600 DDT domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G239601 - -
17 Sobic.004G322300 nucleotide binding protein, putative, expressed K03351: anaphase-promoting complex subunit 4
18 Sobic.003G256600 - -
19 Sobic.002G142700 PPR repeat containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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